Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIU9

Uncharacterized protein FLJ45252 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6PIU9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Q6PIU9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q6PIU9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q6PIU9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q6PIU9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q6PIU9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q6PIU9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q6PIU9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q6PIU9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q6PIU9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q6PIU9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q6PIU9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q6PIU9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q6PIU9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q6PIU9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q6PIU9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q6PIU9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q6PIU9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q6PIU9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q6PIU9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q6PIU9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q6PIU9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q6PIU9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q6PIU9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q6PIU9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q6PIU9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q6PIU9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q6PIU9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Q6PIU9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q6PIU9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q6PIU9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q6PIU9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q6PIU9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q6PIU9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Q6PIU9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q6PIU9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Q6PIU9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q6PIU9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q6PIU9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q6PIU9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q6PIU9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q6PIU9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q6PIU9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q6PIU9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q6PIU9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q6PIU9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q6PIU9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q6PIU9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q6PIU9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q6PIU9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q6PIU9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q6PIU9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q6PIU9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Q6PIU9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q6PIU9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q6PIU9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Q6PIU9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q6PIU9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q6PIU9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q6PIU9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q6PIU9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Q6PIU9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q6PIU9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q6PIU9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q6PIU9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q6PIU9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q6PIU9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q6PIU9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q6PIU9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q6PIU9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q6PIU9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q6PIU9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q6PIU9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q6PIU9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q6PIU9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q6PIU9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q6PIU9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q6PIU9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q6PIU9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q6PIU9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q6PIU9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q6PIU9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q6PIU9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q6PIU9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q6PIU9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q6PIU9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q6PIU9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q6PIU9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q6PIU9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q6PIU9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q6PIU9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q6PIU9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q6PIU9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q6PIU9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q6PIU9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q6PIU9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q6PIU9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q6PIU9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q6PIU9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q6PIU9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms