Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHU5

Sort1, Sortilin, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sort1Q6PHU5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sort1Q6PHU5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sort1Q6PHU5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sort1Q6PHU5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Sort1Q6PHU5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Sort1Q6PHU5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sort1Q6PHU5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sort1Q6PHU5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Sort1Q6PHU5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sort1Q6PHU5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sort1Q6PHU5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sort1Q6PHU5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sort1Q6PHU5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sort1Q6PHU5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sort1Q6PHU5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sort1Q6PHU5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sort1Q6PHU5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sort1Q6PHU5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sort1Q6PHU5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sort1Q6PHU5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sort1Q6PHU5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sort1Q6PHU5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sort1Q6PHU5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sort1Q6PHU5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sort1Q6PHU5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sort1Q6PHU5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sort1Q6PHU5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sort1Q6PHU5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sort1Q6PHU5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sort1Q6PHU5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sort1Q6PHU5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sort1Q6PHU5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sort1Q6PHU5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sort1Q6PHU5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Sort1Q6PHU5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sort1Q6PHU5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sort1Q6PHU5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sort1Q6PHU5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sort1Q6PHU5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sort1Q6PHU5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sort1Q6PHU5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sort1Q6PHU5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sort1Q6PHU5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sort1Q6PHU5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sort1Q6PHU5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sort1Q6PHU5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sort1Q6PHU5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sort1Q6PHU5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sort1Q6PHU5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sort1Q6PHU5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sort1Q6PHU5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sort1Q6PHU5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sort1Q6PHU5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sort1Q6PHU5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sort1Q6PHU5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sort1Q6PHU5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sort1Q6PHU5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sort1Q6PHU5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sort1Q6PHU5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sort1Q6PHU5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sort1Q6PHU5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sort1Q6PHU5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sort1Q6PHU5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sort1Q6PHU5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sort1Q6PHU5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sort1Q6PHU5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sort1Q6PHU5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sort1Q6PHU5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Sort1Q6PHU5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sort1Q6PHU5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sort1Q6PHU5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sort1Q6PHU5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sort1Q6PHU5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Sort1Q6PHU5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sort1Q6PHU5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sort1Q6PHU5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sort1Q6PHU5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sort1Q6PHU5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sort1Q6PHU5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sort1Q6PHU5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sort1Q6PHU5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Sort1Q6PHU5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Sort1Q6PHU5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Sort1Q6PHU5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sort1Q6PHU5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Sort1Q6PHU5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sort1Q6PHU5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sort1Q6PHU5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sort1Q6PHU5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sort1Q6PHU5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sort1Q6PHU5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sort1Q6PHU5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sort1Q6PHU5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Sort1Q6PHU5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sort1Q6PHU5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sort1Q6PHU5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sort1Q6PHU5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sort1Q6PHU5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sort1Q6PHU5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sort1Q6PHU5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 160.4 ms