Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFD7

Naif1, Nuclear apoptosis-inducing factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Naif1Q6PFD7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Naif1Q6PFD7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Naif1Q6PFD7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Naif1Q6PFD7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Naif1Q6PFD7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Naif1Q6PFD7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Naif1Q6PFD7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Naif1Q6PFD7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Naif1Q6PFD7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Naif1Q6PFD7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Naif1Q6PFD7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Naif1Q6PFD7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Naif1Q6PFD7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Naif1Q6PFD7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Naif1Q6PFD7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Naif1Q6PFD7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Naif1Q6PFD7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Naif1Q6PFD7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Naif1Q6PFD7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Naif1Q6PFD7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Naif1Q6PFD7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Naif1Q6PFD7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Naif1Q6PFD7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Naif1Q6PFD7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Naif1Q6PFD7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Naif1Q6PFD7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Naif1Q6PFD7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Naif1Q6PFD7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Naif1Q6PFD7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Naif1Q6PFD7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Naif1Q6PFD7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Naif1Q6PFD7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Naif1Q6PFD7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Naif1Q6PFD7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Naif1Q6PFD7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Naif1Q6PFD7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Naif1Q6PFD7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Naif1Q6PFD7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Naif1Q6PFD7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Naif1Q6PFD7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Naif1Q6PFD7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Naif1Q6PFD7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Naif1Q6PFD7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Naif1Q6PFD7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Naif1Q6PFD7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Naif1Q6PFD7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Naif1Q6PFD7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Naif1Q6PFD7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Naif1Q6PFD7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Naif1Q6PFD7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Naif1Q6PFD7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Naif1Q6PFD7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Naif1Q6PFD7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Naif1Q6PFD7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Naif1Q6PFD7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Naif1Q6PFD7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Naif1Q6PFD7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Naif1Q6PFD7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Naif1Q6PFD7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Naif1Q6PFD7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Naif1Q6PFD7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Naif1Q6PFD7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Naif1Q6PFD7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Naif1Q6PFD7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Naif1Q6PFD7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Naif1Q6PFD7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Naif1Q6PFD7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Naif1Q6PFD7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Naif1Q6PFD7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Naif1Q6PFD7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Naif1Q6PFD7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Naif1Q6PFD7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Naif1Q6PFD7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Naif1Q6PFD7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Naif1Q6PFD7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Naif1Q6PFD7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Naif1Q6PFD7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Naif1Q6PFD7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Naif1Q6PFD7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Naif1Q6PFD7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Naif1Q6PFD7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Naif1Q6PFD7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Naif1Q6PFD7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Naif1Q6PFD7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Naif1Q6PFD7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Naif1Q6PFD7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Naif1Q6PFD7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Naif1Q6PFD7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Naif1Q6PFD7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Naif1Q6PFD7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Naif1Q6PFD7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Naif1Q6PFD7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Naif1Q6PFD7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Naif1Q6PFD7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Naif1Q6PFD7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Naif1Q6PFD7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Naif1Q6PFD7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Naif1Q6PFD7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Naif1Q6PFD7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Naif1Q6PFD7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms