Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEM8

Slc46a1, Proton-coupled folate transporter, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc46a1Q6PEM8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slc46a1Q6PEM8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slc46a1Q6PEM8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc46a1Q6PEM8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc46a1Q6PEM8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc46a1Q6PEM8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc46a1Q6PEM8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc46a1Q6PEM8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc46a1Q6PEM8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc46a1Q6PEM8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc46a1Q6PEM8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc46a1Q6PEM8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc46a1Q6PEM8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc46a1Q6PEM8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc46a1Q6PEM8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc46a1Q6PEM8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc46a1Q6PEM8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc46a1Q6PEM8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc46a1Q6PEM8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc46a1Q6PEM8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc46a1Q6PEM8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc46a1Q6PEM8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc46a1Q6PEM8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc46a1Q6PEM8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc46a1Q6PEM8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc46a1Q6PEM8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc46a1Q6PEM8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc46a1Q6PEM8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc46a1Q6PEM8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc46a1Q6PEM8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc46a1Q6PEM8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc46a1Q6PEM8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc46a1Q6PEM8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc46a1Q6PEM8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc46a1Q6PEM8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc46a1Q6PEM8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc46a1Q6PEM8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc46a1Q6PEM8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc46a1Q6PEM8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc46a1Q6PEM8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc46a1Q6PEM8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc46a1Q6PEM8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc46a1Q6PEM8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc46a1Q6PEM8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc46a1Q6PEM8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc46a1Q6PEM8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc46a1Q6PEM8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc46a1Q6PEM8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc46a1Q6PEM8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc46a1Q6PEM8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc46a1Q6PEM8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc46a1Q6PEM8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc46a1Q6PEM8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc46a1Q6PEM8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc46a1Q6PEM8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc46a1Q6PEM8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc46a1Q6PEM8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc46a1Q6PEM8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc46a1Q6PEM8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc46a1Q6PEM8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc46a1Q6PEM8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc46a1Q6PEM8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc46a1Q6PEM8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Slc46a1Q6PEM8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc46a1Q6PEM8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc46a1Q6PEM8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc46a1Q6PEM8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc46a1Q6PEM8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc46a1Q6PEM8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc46a1Q6PEM8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc46a1Q6PEM8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc46a1Q6PEM8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc46a1Q6PEM8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc46a1Q6PEM8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc46a1Q6PEM8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc46a1Q6PEM8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc46a1Q6PEM8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc46a1Q6PEM8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc46a1Q6PEM8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc46a1Q6PEM8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc46a1Q6PEM8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc46a1Q6PEM8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc46a1Q6PEM8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc46a1Q6PEM8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc46a1Q6PEM8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc46a1Q6PEM8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc46a1Q6PEM8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc46a1Q6PEM8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc46a1Q6PEM8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc46a1Q6PEM8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc46a1Q6PEM8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc46a1Q6PEM8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc46a1Q6PEM8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Slc46a1Q6PEM8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Slc46a1Q6PEM8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc46a1Q6PEM8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc46a1Q6PEM8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc46a1Q6PEM8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc46a1Q6PEM8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc46a1Q6PEM8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms