Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8Y7

Snx31, Sorting nexin-31, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx31Q6P8Y7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Snx31Q6P8Y7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Snx31Q6P8Y7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Snx31Q6P8Y7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Snx31Q6P8Y7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Snx31Q6P8Y7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Snx31Q6P8Y7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Snx31Q6P8Y7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Snx31Q6P8Y7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Snx31Q6P8Y7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Snx31Q6P8Y7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Snx31Q6P8Y7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Snx31Q6P8Y7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Snx31Q6P8Y7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Snx31Q6P8Y7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Snx31Q6P8Y7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Snx31Q6P8Y7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Snx31Q6P8Y7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Snx31Q6P8Y7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Snx31Q6P8Y7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Snx31Q6P8Y7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Snx31Q6P8Y7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Snx31Q6P8Y7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Snx31Q6P8Y7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Snx31Q6P8Y7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Snx31Q6P8Y7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Snx31Q6P8Y7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Snx31Q6P8Y7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Snx31Q6P8Y7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Snx31Q6P8Y7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Snx31Q6P8Y7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Snx31Q6P8Y7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Snx31Q6P8Y7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Snx31Q6P8Y7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Snx31Q6P8Y7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Snx31Q6P8Y7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Snx31Q6P8Y7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Snx31Q6P8Y7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Snx31Q6P8Y7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Snx31Q6P8Y7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Snx31Q6P8Y7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Snx31Q6P8Y7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Snx31Q6P8Y7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Snx31Q6P8Y7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Snx31Q6P8Y7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Snx31Q6P8Y7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Snx31Q6P8Y7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Snx31Q6P8Y7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Snx31Q6P8Y7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Snx31Q6P8Y7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Snx31Q6P8Y7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Snx31Q6P8Y7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Snx31Q6P8Y7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Snx31Q6P8Y7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Snx31Q6P8Y7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Snx31Q6P8Y7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Snx31Q6P8Y7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Snx31Q6P8Y7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Snx31Q6P8Y7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Snx31Q6P8Y7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Snx31Q6P8Y7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Snx31Q6P8Y7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Snx31Q6P8Y7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Snx31Q6P8Y7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Snx31Q6P8Y7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Snx31Q6P8Y7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Snx31Q6P8Y7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Snx31Q6P8Y7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Snx31Q6P8Y7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Snx31Q6P8Y7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Snx31Q6P8Y7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Snx31Q6P8Y7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Snx31Q6P8Y7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Snx31Q6P8Y7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Snx31Q6P8Y7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Snx31Q6P8Y7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Snx31Q6P8Y7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Snx31Q6P8Y7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Snx31Q6P8Y7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Snx31Q6P8Y7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Snx31Q6P8Y7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Snx31Q6P8Y7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Snx31Q6P8Y7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Snx31Q6P8Y7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Snx31Q6P8Y7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Snx31Q6P8Y7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Snx31Q6P8Y7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Snx31Q6P8Y7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Snx31Q6P8Y7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Snx31Q6P8Y7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Snx31Q6P8Y7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Snx31Q6P8Y7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Snx31Q6P8Y7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Snx31Q6P8Y7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snx31Q6P8Y7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Snx31Q6P8Y7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Snx31Q6P8Y7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Snx31Q6P8Y7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Snx31Q6P8Y7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Snx31Q6P8Y7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.2 ms