Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BC061212Q6P8K3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BC061212Q6P8K3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BC061212Q6P8K3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BC061212Q6P8K3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BC061212Q6P8K3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BC061212Q6P8K3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BC061212Q6P8K3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BC061212Q6P8K3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BC061212Q6P8K3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BC061212Q6P8K3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BC061212Q6P8K3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BC061212Q6P8K3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BC061212Q6P8K3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BC061212Q6P8K3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BC061212Q6P8K3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BC061212Q6P8K3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BC061212Q6P8K3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BC061212Q6P8K3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BC061212Q6P8K3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BC061212Q6P8K3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BC061212Q6P8K3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BC061212Q6P8K3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
BC061212Q6P8K3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BC061212Q6P8K3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BC061212Q6P8K3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BC061212Q6P8K3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BC061212Q6P8K3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BC061212Q6P8K3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BC061212Q6P8K3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BC061212Q6P8K3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
BC061212Q6P8K3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BC061212Q6P8K3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BC061212Q6P8K3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BC061212Q6P8K3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BC061212Q6P8K3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
BC061212Q6P8K3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BC061212Q6P8K3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BC061212Q6P8K3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BC061212Q6P8K3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BC061212Q6P8K3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BC061212Q6P8K3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BC061212Q6P8K3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BC061212Q6P8K3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BC061212Q6P8K3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BC061212Q6P8K3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BC061212Q6P8K3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BC061212Q6P8K3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BC061212Q6P8K3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BC061212Q6P8K3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BC061212Q6P8K3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BC061212Q6P8K3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BC061212Q6P8K3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BC061212Q6P8K3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BC061212Q6P8K3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BC061212Q6P8K3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BC061212Q6P8K3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BC061212Q6P8K3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BC061212Q6P8K3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BC061212Q6P8K3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BC061212Q6P8K3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BC061212Q6P8K3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BC061212Q6P8K3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BC061212Q6P8K3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BC061212Q6P8K3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BC061212Q6P8K3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BC061212Q6P8K3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BC061212Q6P8K3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BC061212Q6P8K3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BC061212Q6P8K3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BC061212Q6P8K3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BC061212Q6P8K3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BC061212Q6P8K3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BC061212Q6P8K3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BC061212Q6P8K3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BC061212Q6P8K3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BC061212Q6P8K3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BC061212Q6P8K3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BC061212Q6P8K3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BC061212Q6P8K3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BC061212Q6P8K3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BC061212Q6P8K3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BC061212Q6P8K3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BC061212Q6P8K3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BC061212Q6P8K3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BC061212Q6P8K3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BC061212Q6P8K3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BC061212Q6P8K3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BC061212Q6P8K3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BC061212Q6P8K3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BC061212Q6P8K3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BC061212Q6P8K3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BC061212Q6P8K3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BC061212Q6P8K3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BC061212Q6P8K3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BC061212Q6P8K3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
BC061212Q6P8K3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BC061212Q6P8K3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BC061212Q6P8K3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BC061212Q6P8K3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms