Protein–RNA interactions for Protein: Q6P6J4

Alkbh2, DNA oxidative demethylase ALKBH2, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh2Q6P6J4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Alkbh2Q6P6J4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Alkbh2Q6P6J4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Alkbh2Q6P6J4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Alkbh2Q6P6J4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Alkbh2Q6P6J4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Alkbh2Q6P6J4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Alkbh2Q6P6J4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Alkbh2Q6P6J4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Alkbh2Q6P6J4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Alkbh2Q6P6J4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Alkbh2Q6P6J4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Alkbh2Q6P6J4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Alkbh2Q6P6J4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Alkbh2Q6P6J4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Alkbh2Q6P6J4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Alkbh2Q6P6J4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Alkbh2Q6P6J4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Alkbh2Q6P6J4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Alkbh2Q6P6J4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Alkbh2Q6P6J4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Alkbh2Q6P6J4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Alkbh2Q6P6J4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Alkbh2Q6P6J4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Alkbh2Q6P6J4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Alkbh2Q6P6J4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Alkbh2Q6P6J4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Alkbh2Q6P6J4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Alkbh2Q6P6J4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Alkbh2Q6P6J4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Alkbh2Q6P6J4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Alkbh2Q6P6J4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Alkbh2Q6P6J4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Alkbh2Q6P6J4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Alkbh2Q6P6J4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Alkbh2Q6P6J4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Alkbh2Q6P6J4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Alkbh2Q6P6J4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Alkbh2Q6P6J4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Alkbh2Q6P6J4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Alkbh2Q6P6J4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Alkbh2Q6P6J4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Alkbh2Q6P6J4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Alkbh2Q6P6J4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Alkbh2Q6P6J4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Alkbh2Q6P6J4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Alkbh2Q6P6J4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Alkbh2Q6P6J4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Alkbh2Q6P6J4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Alkbh2Q6P6J4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Alkbh2Q6P6J4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Alkbh2Q6P6J4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Alkbh2Q6P6J4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Alkbh2Q6P6J4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Alkbh2Q6P6J4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Alkbh2Q6P6J4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Alkbh2Q6P6J4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Alkbh2Q6P6J4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Alkbh2Q6P6J4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Alkbh2Q6P6J4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Alkbh2Q6P6J4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Alkbh2Q6P6J4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Alkbh2Q6P6J4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Alkbh2Q6P6J4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Alkbh2Q6P6J4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Alkbh2Q6P6J4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Alkbh2Q6P6J4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Alkbh2Q6P6J4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Alkbh2Q6P6J4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Alkbh2Q6P6J4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Alkbh2Q6P6J4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Alkbh2Q6P6J4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Alkbh2Q6P6J4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Alkbh2Q6P6J4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Alkbh2Q6P6J4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Alkbh2Q6P6J4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Alkbh2Q6P6J4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Alkbh2Q6P6J4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Alkbh2Q6P6J4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Alkbh2Q6P6J4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Alkbh2Q6P6J4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Alkbh2Q6P6J4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Alkbh2Q6P6J4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Alkbh2Q6P6J4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Alkbh2Q6P6J4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Alkbh2Q6P6J4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Alkbh2Q6P6J4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Alkbh2Q6P6J4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Alkbh2Q6P6J4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Alkbh2Q6P6J4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Alkbh2Q6P6J4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Alkbh2Q6P6J4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Alkbh2Q6P6J4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Alkbh2Q6P6J4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Alkbh2Q6P6J4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Alkbh2Q6P6J4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Alkbh2Q6P6J4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Alkbh2Q6P6J4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Alkbh2Q6P6J4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Alkbh2Q6P6J4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 244.9 ms