Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5E6

Gga2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga2Q6P5E6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gga2Q6P5E6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gga2Q6P5E6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gga2Q6P5E6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gga2Q6P5E6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gga2Q6P5E6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gga2Q6P5E6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gga2Q6P5E6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gga2Q6P5E6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gga2Q6P5E6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gga2Q6P5E6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Gga2Q6P5E6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gga2Q6P5E6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gga2Q6P5E6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gga2Q6P5E6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gga2Q6P5E6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gga2Q6P5E6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gga2Q6P5E6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gga2Q6P5E6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gga2Q6P5E6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gga2Q6P5E6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gga2Q6P5E6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Gga2Q6P5E6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gga2Q6P5E6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gga2Q6P5E6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gga2Q6P5E6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gga2Q6P5E6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gga2Q6P5E6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gga2Q6P5E6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Gga2Q6P5E6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gga2Q6P5E6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gga2Q6P5E6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gga2Q6P5E6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gga2Q6P5E6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gga2Q6P5E6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gga2Q6P5E6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gga2Q6P5E6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gga2Q6P5E6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gga2Q6P5E6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gga2Q6P5E6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gga2Q6P5E6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gga2Q6P5E6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gga2Q6P5E6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Gga2Q6P5E6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gga2Q6P5E6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Gga2Q6P5E6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gga2Q6P5E6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gga2Q6P5E6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gga2Q6P5E6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gga2Q6P5E6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gga2Q6P5E6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gga2Q6P5E6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gga2Q6P5E6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gga2Q6P5E6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gga2Q6P5E6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gga2Q6P5E6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gga2Q6P5E6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gga2Q6P5E6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gga2Q6P5E6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gga2Q6P5E6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gga2Q6P5E6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gga2Q6P5E6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gga2Q6P5E6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Gga2Q6P5E6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gga2Q6P5E6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gga2Q6P5E6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gga2Q6P5E6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gga2Q6P5E6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gga2Q6P5E6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gga2Q6P5E6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gga2Q6P5E6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gga2Q6P5E6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gga2Q6P5E6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gga2Q6P5E6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gga2Q6P5E6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gga2Q6P5E6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gga2Q6P5E6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gga2Q6P5E6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gga2Q6P5E6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gga2Q6P5E6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gga2Q6P5E6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gga2Q6P5E6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gga2Q6P5E6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gga2Q6P5E6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gga2Q6P5E6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gga2Q6P5E6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gga2Q6P5E6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gga2Q6P5E6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gga2Q6P5E6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gga2Q6P5E6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gga2Q6P5E6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gga2Q6P5E6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gga2Q6P5E6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gga2Q6P5E6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gga2Q6P5E6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gga2Q6P5E6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gga2Q6P5E6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gga2Q6P5E6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gga2Q6P5E6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gga2Q6P5E6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms