Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2L7

Casc4, Protein CASC4, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc4Q6P2L7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Casc4Q6P2L7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Casc4Q6P2L7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Casc4Q6P2L7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Casc4Q6P2L7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Casc4Q6P2L7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Casc4Q6P2L7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Casc4Q6P2L7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
Casc4Q6P2L7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Casc4Q6P2L7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Casc4Q6P2L7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Casc4Q6P2L7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Casc4Q6P2L7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Casc4Q6P2L7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Casc4Q6P2L7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Casc4Q6P2L7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Casc4Q6P2L7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Casc4Q6P2L7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Casc4Q6P2L7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Casc4Q6P2L7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Casc4Q6P2L7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Casc4Q6P2L7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Casc4Q6P2L7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Casc4Q6P2L7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Casc4Q6P2L7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Casc4Q6P2L7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Casc4Q6P2L7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Casc4Q6P2L7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Casc4Q6P2L7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Casc4Q6P2L7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Casc4Q6P2L7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Casc4Q6P2L7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Casc4Q6P2L7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Casc4Q6P2L7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Casc4Q6P2L7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Casc4Q6P2L7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Casc4Q6P2L7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Casc4Q6P2L7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Casc4Q6P2L7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Casc4Q6P2L7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Casc4Q6P2L7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Casc4Q6P2L7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Casc4Q6P2L7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Casc4Q6P2L7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Casc4Q6P2L7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Casc4Q6P2L7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Casc4Q6P2L7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Casc4Q6P2L7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Casc4Q6P2L7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Casc4Q6P2L7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Casc4Q6P2L7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Casc4Q6P2L7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Casc4Q6P2L7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Casc4Q6P2L7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Casc4Q6P2L7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Casc4Q6P2L7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Casc4Q6P2L7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Casc4Q6P2L7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Casc4Q6P2L7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Casc4Q6P2L7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Casc4Q6P2L7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Casc4Q6P2L7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Casc4Q6P2L7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Casc4Q6P2L7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Casc4Q6P2L7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Casc4Q6P2L7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Casc4Q6P2L7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Casc4Q6P2L7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Casc4Q6P2L7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Casc4Q6P2L7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Casc4Q6P2L7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Casc4Q6P2L7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Casc4Q6P2L7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Casc4Q6P2L7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Casc4Q6P2L7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Casc4Q6P2L7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Casc4Q6P2L7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Casc4Q6P2L7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Casc4Q6P2L7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Casc4Q6P2L7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Casc4Q6P2L7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Casc4Q6P2L7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Casc4Q6P2L7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Casc4Q6P2L7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Casc4Q6P2L7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Casc4Q6P2L7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Casc4Q6P2L7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Casc4Q6P2L7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Casc4Q6P2L7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Casc4Q6P2L7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Casc4Q6P2L7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Casc4Q6P2L7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Casc4Q6P2L7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Casc4Q6P2L7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Casc4Q6P2L7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Casc4Q6P2L7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Casc4Q6P2L7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Casc4Q6P2L7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Casc4Q6P2L7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Casc4Q6P2L7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.8 ms