Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Krt39Q6IFX4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Krt39Q6IFX4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Krt39Q6IFX4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Krt39Q6IFX4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Krt39Q6IFX4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Krt39Q6IFX4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Krt39Q6IFX4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Krt39Q6IFX4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Krt39Q6IFX4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Krt39Q6IFX4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Krt39Q6IFX4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Krt39Q6IFX4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Krt39Q6IFX4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Krt39Q6IFX4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Krt39Q6IFX4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Krt39Q6IFX4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Krt39Q6IFX4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Krt39Q6IFX4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Krt39Q6IFX4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Krt39Q6IFX4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Krt39Q6IFX4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Krt39Q6IFX4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Krt39Q6IFX4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Krt39Q6IFX4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Krt39Q6IFX4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Krt39Q6IFX4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Krt39Q6IFX4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Krt39Q6IFX4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Krt39Q6IFX4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Krt39Q6IFX4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Krt39Q6IFX4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Krt39Q6IFX4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Krt39Q6IFX4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Krt39Q6IFX4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Krt39Q6IFX4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Krt39Q6IFX4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Krt39Q6IFX4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Krt39Q6IFX4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Krt39Q6IFX4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Krt39Q6IFX4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Krt39Q6IFX4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Krt39Q6IFX4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Krt39Q6IFX4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Krt39Q6IFX4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Krt39Q6IFX4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Krt39Q6IFX4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Krt39Q6IFX4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Krt39Q6IFX4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Krt39Q6IFX4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Krt39Q6IFX4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Krt39Q6IFX4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Krt39Q6IFX4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Krt39Q6IFX4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Krt39Q6IFX4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Krt39Q6IFX4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Krt39Q6IFX4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Krt39Q6IFX4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Krt39Q6IFX4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Krt39Q6IFX4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Krt39Q6IFX4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Krt39Q6IFX4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Krt39Q6IFX4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Krt39Q6IFX4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Krt39Q6IFX4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Krt39Q6IFX4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Krt39Q6IFX4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Krt39Q6IFX4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Krt39Q6IFX4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Krt39Q6IFX4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Krt39Q6IFX4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Krt39Q6IFX4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Krt39Q6IFX4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Krt39Q6IFX4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Krt39Q6IFX4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Krt39Q6IFX4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Krt39Q6IFX4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Krt39Q6IFX4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Krt39Q6IFX4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Krt39Q6IFX4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Krt39Q6IFX4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Krt39Q6IFX4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Krt39Q6IFX4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Krt39Q6IFX4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Krt39Q6IFX4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Krt39Q6IFX4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Krt39Q6IFX4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Krt39Q6IFX4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Krt39Q6IFX4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Krt39Q6IFX4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Krt39Q6IFX4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Krt39Q6IFX4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Krt39Q6IFX4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Krt39Q6IFX4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Krt39Q6IFX4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Krt39Q6IFX4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Krt39Q6IFX4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Krt39Q6IFX4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Krt39Q6IFX4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Krt39Q6IFX4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms