Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZU6

Thsd7a, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7A, mousemouse

Predictions only

Length 1,645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd7aQ69ZU6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Thsd7aQ69ZU6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
Thsd7aQ69ZU6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Thsd7aQ69ZU6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Thsd7aQ69ZU6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Thsd7aQ69ZU6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Thsd7aQ69ZU6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Thsd7aQ69ZU6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Thsd7aQ69ZU6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Thsd7aQ69ZU6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Thsd7aQ69ZU6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Thsd7aQ69ZU6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
Thsd7aQ69ZU6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
Thsd7aQ69ZU6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Thsd7aQ69ZU6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Thsd7aQ69ZU6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Thsd7aQ69ZU6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Thsd7aQ69ZU6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Thsd7aQ69ZU6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Thsd7aQ69ZU6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
Thsd7aQ69ZU6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Thsd7aQ69ZU6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Thsd7aQ69ZU6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Thsd7aQ69ZU6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
Thsd7aQ69ZU6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Thsd7aQ69ZU6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Thsd7aQ69ZU6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Thsd7aQ69ZU6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Thsd7aQ69ZU6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.35
Thsd7aQ69ZU6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Thsd7aQ69ZU6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Thsd7aQ69ZU6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Thsd7aQ69ZU6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Thsd7aQ69ZU6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Thsd7aQ69ZU6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Thsd7aQ69ZU6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
Thsd7aQ69ZU6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Thsd7aQ69ZU6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Thsd7aQ69ZU6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Thsd7aQ69ZU6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Thsd7aQ69ZU6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Thsd7aQ69ZU6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Thsd7aQ69ZU6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Thsd7aQ69ZU6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Thsd7aQ69ZU6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Thsd7aQ69ZU6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Thsd7aQ69ZU6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Thsd7aQ69ZU6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Thsd7aQ69ZU6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Thsd7aQ69ZU6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Thsd7aQ69ZU6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Thsd7aQ69ZU6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Thsd7aQ69ZU6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Thsd7aQ69ZU6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Thsd7aQ69ZU6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Thsd7aQ69ZU6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Thsd7aQ69ZU6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC35.69■■■■□ 3.3
Thsd7aQ69ZU6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC35.69■■■■□ 3.3
Thsd7aQ69ZU6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Thsd7aQ69ZU6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Thsd7aQ69ZU6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Thsd7aQ69ZU6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Thsd7aQ69ZU6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Thsd7aQ69ZU6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Thsd7aQ69ZU6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
Thsd7aQ69ZU6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Thsd7aQ69ZU6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
Thsd7aQ69ZU6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC35.61■■■■□ 3.29
Thsd7aQ69ZU6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Thsd7aQ69ZU6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Thsd7aQ69ZU6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Thsd7aQ69ZU6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Thsd7aQ69ZU6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.58■■■■□ 3.29
Thsd7aQ69ZU6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
Thsd7aQ69ZU6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Thsd7aQ69ZU6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Thsd7aQ69ZU6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Thsd7aQ69ZU6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Thsd7aQ69ZU6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Thsd7aQ69ZU6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Thsd7aQ69ZU6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Thsd7aQ69ZU6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Thsd7aQ69ZU6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Thsd7aQ69ZU6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Thsd7aQ69ZU6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
Thsd7aQ69ZU6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC35.51■■■■□ 3.27
Thsd7aQ69ZU6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Thsd7aQ69ZU6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Thsd7aQ69ZU6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Thsd7aQ69ZU6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Thsd7aQ69ZU6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Thsd7aQ69ZU6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
Thsd7aQ69ZU6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
Thsd7aQ69ZU6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.26
Thsd7aQ69ZU6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Thsd7aQ69ZU6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Thsd7aQ69ZU6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Thsd7aQ69ZU6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Thsd7aQ69ZU6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
Thsd7aQ69ZU6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms