Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZT9

Tbc1d30, TBC1 domain family member 30, mousemouse

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d30Q69ZT9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Tbc1d30Q69ZT9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tbc1d30Q69ZT9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Tbc1d30Q69ZT9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Tbc1d30Q69ZT9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Tbc1d30Q69ZT9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Tbc1d30Q69ZT9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Tbc1d30Q69ZT9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Tbc1d30Q69ZT9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Tbc1d30Q69ZT9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Tbc1d30Q69ZT9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Tbc1d30Q69ZT9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Tbc1d30Q69ZT9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Tbc1d30Q69ZT9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Tbc1d30Q69ZT9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Tbc1d30Q69ZT9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Tbc1d30Q69ZT9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Tbc1d30Q69ZT9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Tbc1d30Q69ZT9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tbc1d30Q69ZT9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Tbc1d30Q69ZT9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Tbc1d30Q69ZT9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tbc1d30Q69ZT9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tbc1d30Q69ZT9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tbc1d30Q69ZT9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tbc1d30Q69ZT9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tbc1d30Q69ZT9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tbc1d30Q69ZT9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tbc1d30Q69ZT9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Tbc1d30Q69ZT9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Tbc1d30Q69ZT9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Tbc1d30Q69ZT9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tbc1d30Q69ZT9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tbc1d30Q69ZT9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tbc1d30Q69ZT9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tbc1d30Q69ZT9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tbc1d30Q69ZT9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tbc1d30Q69ZT9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tbc1d30Q69ZT9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tbc1d30Q69ZT9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tbc1d30Q69ZT9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tbc1d30Q69ZT9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tbc1d30Q69ZT9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tbc1d30Q69ZT9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tbc1d30Q69ZT9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tbc1d30Q69ZT9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tbc1d30Q69ZT9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tbc1d30Q69ZT9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tbc1d30Q69ZT9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Tbc1d30Q69ZT9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Tbc1d30Q69ZT9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tbc1d30Q69ZT9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tbc1d30Q69ZT9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tbc1d30Q69ZT9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tbc1d30Q69ZT9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tbc1d30Q69ZT9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tbc1d30Q69ZT9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tbc1d30Q69ZT9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tbc1d30Q69ZT9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tbc1d30Q69ZT9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tbc1d30Q69ZT9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tbc1d30Q69ZT9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Tbc1d30Q69ZT9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tbc1d30Q69ZT9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tbc1d30Q69ZT9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tbc1d30Q69ZT9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tbc1d30Q69ZT9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tbc1d30Q69ZT9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tbc1d30Q69ZT9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tbc1d30Q69ZT9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tbc1d30Q69ZT9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Tbc1d30Q69ZT9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Tbc1d30Q69ZT9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tbc1d30Q69ZT9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tbc1d30Q69ZT9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tbc1d30Q69ZT9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tbc1d30Q69ZT9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tbc1d30Q69ZT9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tbc1d30Q69ZT9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Tbc1d30Q69ZT9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Tbc1d30Q69ZT9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Tbc1d30Q69ZT9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Tbc1d30Q69ZT9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Tbc1d30Q69ZT9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Tbc1d30Q69ZT9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tbc1d30Q69ZT9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tbc1d30Q69ZT9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tbc1d30Q69ZT9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tbc1d30Q69ZT9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tbc1d30Q69ZT9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tbc1d30Q69ZT9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tbc1d30Q69ZT9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tbc1d30Q69ZT9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tbc1d30Q69ZT9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tbc1d30Q69ZT9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tbc1d30Q69ZT9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tbc1d30Q69ZT9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tbc1d30Q69ZT9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tbc1d30Q69ZT9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tbc1d30Q69ZT9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms