Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD9

Kiaa1549, UPF0606 protein KIAA1549, mousemouse

Predictions only

Length 1,940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kiaa1549Q68FD9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kiaa1549Q68FD9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kiaa1549Q68FD9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kiaa1549Q68FD9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Kiaa1549Q68FD9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Kiaa1549Q68FD9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kiaa1549Q68FD9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kiaa1549Q68FD9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Kiaa1549Q68FD9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kiaa1549Q68FD9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kiaa1549Q68FD9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Kiaa1549Q68FD9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kiaa1549Q68FD9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kiaa1549Q68FD9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kiaa1549Q68FD9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kiaa1549Q68FD9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kiaa1549Q68FD9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kiaa1549Q68FD9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kiaa1549Q68FD9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kiaa1549Q68FD9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kiaa1549Q68FD9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kiaa1549Q68FD9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kiaa1549Q68FD9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kiaa1549Q68FD9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kiaa1549Q68FD9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kiaa1549Q68FD9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kiaa1549Q68FD9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kiaa1549Q68FD9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kiaa1549Q68FD9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Kiaa1549Q68FD9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kiaa1549Q68FD9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kiaa1549Q68FD9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kiaa1549Q68FD9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kiaa1549Q68FD9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kiaa1549Q68FD9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kiaa1549Q68FD9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kiaa1549Q68FD9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Kiaa1549Q68FD9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Kiaa1549Q68FD9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Kiaa1549Q68FD9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kiaa1549Q68FD9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Kiaa1549Q68FD9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kiaa1549Q68FD9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kiaa1549Q68FD9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kiaa1549Q68FD9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kiaa1549Q68FD9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kiaa1549Q68FD9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kiaa1549Q68FD9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kiaa1549Q68FD9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kiaa1549Q68FD9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kiaa1549Q68FD9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kiaa1549Q68FD9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kiaa1549Q68FD9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kiaa1549Q68FD9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Kiaa1549Q68FD9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kiaa1549Q68FD9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kiaa1549Q68FD9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kiaa1549Q68FD9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kiaa1549Q68FD9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kiaa1549Q68FD9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kiaa1549Q68FD9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kiaa1549Q68FD9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kiaa1549Q68FD9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kiaa1549Q68FD9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Kiaa1549Q68FD9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kiaa1549Q68FD9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kiaa1549Q68FD9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kiaa1549Q68FD9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kiaa1549Q68FD9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kiaa1549Q68FD9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kiaa1549Q68FD9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kiaa1549Q68FD9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kiaa1549Q68FD9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kiaa1549Q68FD9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kiaa1549Q68FD9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kiaa1549Q68FD9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kiaa1549Q68FD9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Kiaa1549Q68FD9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Kiaa1549Q68FD9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Kiaa1549Q68FD9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kiaa1549Q68FD9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kiaa1549Q68FD9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kiaa1549Q68FD9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kiaa1549Q68FD9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kiaa1549Q68FD9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kiaa1549Q68FD9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Kiaa1549Q68FD9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kiaa1549Q68FD9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kiaa1549Q68FD9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kiaa1549Q68FD9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kiaa1549Q68FD9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Kiaa1549Q68FD9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kiaa1549Q68FD9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kiaa1549Q68FD9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kiaa1549Q68FD9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kiaa1549Q68FD9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kiaa1549Q68FD9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kiaa1549Q68FD9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kiaa1549Q68FD9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kiaa1549Q68FD9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms