Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PtprdQ64487 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PtprdQ64487 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PtprdQ64487 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PtprdQ64487 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PtprdQ64487 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PtprdQ64487 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PtprdQ64487 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PtprdQ64487 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PtprdQ64487 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PtprdQ64487 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PtprdQ64487 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PtprdQ64487 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PtprdQ64487 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PtprdQ64487 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PtprdQ64487 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PtprdQ64487 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PtprdQ64487 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PtprdQ64487 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PtprdQ64487 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PtprdQ64487 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PtprdQ64487 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PtprdQ64487 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PtprdQ64487 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PtprdQ64487 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PtprdQ64487 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PtprdQ64487 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PtprdQ64487 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PtprdQ64487 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PtprdQ64487 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PtprdQ64487 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PtprdQ64487 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PtprdQ64487 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PtprdQ64487 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PtprdQ64487 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PtprdQ64487 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PtprdQ64487 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PtprdQ64487 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.76
PtprdQ64487 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PtprdQ64487 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PtprdQ64487 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PtprdQ64487 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PtprdQ64487 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PtprdQ64487 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PtprdQ64487 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PtprdQ64487 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PtprdQ64487 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PtprdQ64487 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PtprdQ64487 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PtprdQ64487 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PtprdQ64487 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PtprdQ64487 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PtprdQ64487 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PtprdQ64487 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PtprdQ64487 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PtprdQ64487 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PtprdQ64487 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PtprdQ64487 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PtprdQ64487 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PtprdQ64487 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PtprdQ64487 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PtprdQ64487 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PtprdQ64487 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PtprdQ64487 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PtprdQ64487 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PtprdQ64487 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PtprdQ64487 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PtprdQ64487 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PtprdQ64487 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PtprdQ64487 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PtprdQ64487 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PtprdQ64487 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PtprdQ64487 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PtprdQ64487 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PtprdQ64487 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PtprdQ64487 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PtprdQ64487 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PtprdQ64487 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PtprdQ64487 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PtprdQ64487 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PtprdQ64487 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PtprdQ64487 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PtprdQ64487 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PtprdQ64487 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PtprdQ64487 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PtprdQ64487 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PtprdQ64487 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PtprdQ64487 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PtprdQ64487 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PtprdQ64487 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PtprdQ64487 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PtprdQ64487 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PtprdQ64487 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PtprdQ64487 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PtprdQ64487 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PtprdQ64487 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PtprdQ64487 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PtprdQ64487 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PtprdQ64487 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PtprdQ64487 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
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