Protein–RNA interactions for Protein: Q64213

Sf1, Splicing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf1Q64213 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sf1Q64213 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sf1Q64213 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Sf1Q64213 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Sf1Q64213 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Sf1Q64213 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sf1Q64213 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sf1Q64213 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sf1Q64213 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sf1Q64213 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sf1Q64213 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sf1Q64213 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sf1Q64213 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sf1Q64213 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sf1Q64213 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sf1Q64213 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sf1Q64213 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sf1Q64213 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sf1Q64213 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sf1Q64213 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Sf1Q64213 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sf1Q64213 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sf1Q64213 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sf1Q64213 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sf1Q64213 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sf1Q64213 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sf1Q64213 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sf1Q64213 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sf1Q64213 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sf1Q64213 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Sf1Q64213 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sf1Q64213 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sf1Q64213 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sf1Q64213 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Sf1Q64213 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sf1Q64213 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sf1Q64213 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sf1Q64213 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sf1Q64213 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sf1Q64213 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sf1Q64213 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sf1Q64213 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sf1Q64213 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sf1Q64213 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sf1Q64213 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Sf1Q64213 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sf1Q64213 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sf1Q64213 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sf1Q64213 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sf1Q64213 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sf1Q64213 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sf1Q64213 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sf1Q64213 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Sf1Q64213 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sf1Q64213 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sf1Q64213 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sf1Q64213 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sf1Q64213 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sf1Q64213 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sf1Q64213 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Sf1Q64213 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sf1Q64213 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sf1Q64213 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sf1Q64213 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sf1Q64213 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Sf1Q64213 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sf1Q64213 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Sf1Q64213 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sf1Q64213 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sf1Q64213 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sf1Q64213 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sf1Q64213 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sf1Q64213 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sf1Q64213 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sf1Q64213 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sf1Q64213 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sf1Q64213 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sf1Q64213 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sf1Q64213 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sf1Q64213 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sf1Q64213 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sf1Q64213 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sf1Q64213 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sf1Q64213 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sf1Q64213 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Sf1Q64213 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sf1Q64213 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sf1Q64213 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sf1Q64213 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sf1Q64213 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sf1Q64213 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sf1Q64213 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Sf1Q64213 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sf1Q64213 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sf1Q64213 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sf1Q64213 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sf1Q64213 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sf1Q64213 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sf1Q64213 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Sf1Q64213 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms