Protein–RNA interactions for Protein: Q640R3

Hepacam, Hepatocyte cell adhesion molecule, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HepacamQ640R3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HepacamQ640R3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HepacamQ640R3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HepacamQ640R3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HepacamQ640R3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HepacamQ640R3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HepacamQ640R3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HepacamQ640R3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HepacamQ640R3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HepacamQ640R3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HepacamQ640R3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HepacamQ640R3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HepacamQ640R3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HepacamQ640R3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HepacamQ640R3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HepacamQ640R3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HepacamQ640R3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HepacamQ640R3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HepacamQ640R3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HepacamQ640R3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HepacamQ640R3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HepacamQ640R3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HepacamQ640R3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HepacamQ640R3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HepacamQ640R3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HepacamQ640R3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HepacamQ640R3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HepacamQ640R3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HepacamQ640R3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HepacamQ640R3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HepacamQ640R3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HepacamQ640R3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HepacamQ640R3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HepacamQ640R3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HepacamQ640R3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HepacamQ640R3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HepacamQ640R3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HepacamQ640R3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HepacamQ640R3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HepacamQ640R3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HepacamQ640R3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HepacamQ640R3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HepacamQ640R3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HepacamQ640R3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HepacamQ640R3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
HepacamQ640R3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HepacamQ640R3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HepacamQ640R3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HepacamQ640R3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HepacamQ640R3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HepacamQ640R3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HepacamQ640R3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HepacamQ640R3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HepacamQ640R3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HepacamQ640R3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HepacamQ640R3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HepacamQ640R3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HepacamQ640R3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HepacamQ640R3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HepacamQ640R3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HepacamQ640R3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HepacamQ640R3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HepacamQ640R3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HepacamQ640R3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HepacamQ640R3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HepacamQ640R3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HepacamQ640R3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HepacamQ640R3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HepacamQ640R3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HepacamQ640R3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HepacamQ640R3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HepacamQ640R3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HepacamQ640R3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HepacamQ640R3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HepacamQ640R3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HepacamQ640R3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HepacamQ640R3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HepacamQ640R3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HepacamQ640R3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HepacamQ640R3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HepacamQ640R3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HepacamQ640R3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HepacamQ640R3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HepacamQ640R3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HepacamQ640R3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HepacamQ640R3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HepacamQ640R3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HepacamQ640R3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HepacamQ640R3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HepacamQ640R3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HepacamQ640R3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HepacamQ640R3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HepacamQ640R3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HepacamQ640R3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HepacamQ640R3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HepacamQ640R3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HepacamQ640R3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HepacamQ640R3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HepacamQ640R3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HepacamQ640R3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms