Protein–RNA interactions for Protein: Q62313

Tgoln1, Trans-Golgi network integral membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgoln1Q62313 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tgoln1Q62313 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tgoln1Q62313 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tgoln1Q62313 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tgoln1Q62313 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tgoln1Q62313 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tgoln1Q62313 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tgoln1Q62313 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tgoln1Q62313 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tgoln1Q62313 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tgoln1Q62313 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tgoln1Q62313 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tgoln1Q62313 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tgoln1Q62313 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tgoln1Q62313 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tgoln1Q62313 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tgoln1Q62313 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tgoln1Q62313 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tgoln1Q62313 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tgoln1Q62313 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tgoln1Q62313 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tgoln1Q62313 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tgoln1Q62313 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tgoln1Q62313 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tgoln1Q62313 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tgoln1Q62313 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tgoln1Q62313 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tgoln1Q62313 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tgoln1Q62313 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tgoln1Q62313 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tgoln1Q62313 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tgoln1Q62313 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tgoln1Q62313 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tgoln1Q62313 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tgoln1Q62313 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tgoln1Q62313 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Tgoln1Q62313 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tgoln1Q62313 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tgoln1Q62313 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tgoln1Q62313 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tgoln1Q62313 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tgoln1Q62313 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tgoln1Q62313 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tgoln1Q62313 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tgoln1Q62313 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tgoln1Q62313 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tgoln1Q62313 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tgoln1Q62313 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tgoln1Q62313 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tgoln1Q62313 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tgoln1Q62313 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tgoln1Q62313 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tgoln1Q62313 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tgoln1Q62313 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tgoln1Q62313 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tgoln1Q62313 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tgoln1Q62313 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tgoln1Q62313 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tgoln1Q62313 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tgoln1Q62313 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tgoln1Q62313 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tgoln1Q62313 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tgoln1Q62313 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tgoln1Q62313 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tgoln1Q62313 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tgoln1Q62313 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tgoln1Q62313 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tgoln1Q62313 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tgoln1Q62313 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tgoln1Q62313 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tgoln1Q62313 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tgoln1Q62313 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tgoln1Q62313 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tgoln1Q62313 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tgoln1Q62313 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tgoln1Q62313 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tgoln1Q62313 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tgoln1Q62313 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tgoln1Q62313 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tgoln1Q62313 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Tgoln1Q62313 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tgoln1Q62313 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tgoln1Q62313 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tgoln1Q62313 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tgoln1Q62313 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tgoln1Q62313 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tgoln1Q62313 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tgoln1Q62313 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tgoln1Q62313 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tgoln1Q62313 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tgoln1Q62313 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tgoln1Q62313 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tgoln1Q62313 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tgoln1Q62313 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tgoln1Q62313 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tgoln1Q62313 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Tgoln1Q62313 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tgoln1Q62313 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tgoln1Q62313 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tgoln1Q62313 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 215.7 ms