Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Taf6Q62311 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Taf6Q62311 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Taf6Q62311 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Taf6Q62311 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Taf6Q62311 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Taf6Q62311 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Taf6Q62311 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Taf6Q62311 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Taf6Q62311 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Taf6Q62311 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Taf6Q62311 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Taf6Q62311 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Taf6Q62311 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Taf6Q62311 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Taf6Q62311 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Taf6Q62311 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Taf6Q62311 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Taf6Q62311 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Taf6Q62311 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Taf6Q62311 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Taf6Q62311 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Taf6Q62311 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Taf6Q62311 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Taf6Q62311 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Taf6Q62311 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Taf6Q62311 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Taf6Q62311 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Taf6Q62311 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Taf6Q62311 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Taf6Q62311 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Taf6Q62311 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Taf6Q62311 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Taf6Q62311 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Taf6Q62311 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Taf6Q62311 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Taf6Q62311 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Taf6Q62311 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Taf6Q62311 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Taf6Q62311 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Taf6Q62311 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Taf6Q62311 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Taf6Q62311 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Taf6Q62311 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Taf6Q62311 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Taf6Q62311 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Taf6Q62311 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Taf6Q62311 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Taf6Q62311 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Taf6Q62311 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Taf6Q62311 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Taf6Q62311 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Taf6Q62311 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Taf6Q62311 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Taf6Q62311 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Taf6Q62311 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Taf6Q62311 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Taf6Q62311 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Taf6Q62311 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Taf6Q62311 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Taf6Q62311 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Taf6Q62311 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Taf6Q62311 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Taf6Q62311 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Taf6Q62311 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Taf6Q62311 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Taf6Q62311 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Taf6Q62311 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Taf6Q62311 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Taf6Q62311 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Taf6Q62311 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Taf6Q62311 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Taf6Q62311 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Taf6Q62311 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Taf6Q62311 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Taf6Q62311 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Taf6Q62311 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Taf6Q62311 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Taf6Q62311 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Taf6Q62311 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Taf6Q62311 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Taf6Q62311 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Taf6Q62311 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Taf6Q62311 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Taf6Q62311 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Taf6Q62311 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Taf6Q62311 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Taf6Q62311 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Taf6Q62311 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Taf6Q62311 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Taf6Q62311 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Taf6Q62311 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Taf6Q62311 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Taf6Q62311 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Taf6Q62311 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Taf6Q62311 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Taf6Q62311 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Taf6Q62311 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Taf6Q62311 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Taf6Q62311 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.9 ms