Protein–RNA interactions for Protein: Q62267

Sprr1b, Cornifin-B, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr1bQ62267 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sprr1bQ62267 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sprr1bQ62267 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sprr1bQ62267 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sprr1bQ62267 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sprr1bQ62267 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sprr1bQ62267 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sprr1bQ62267 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sprr1bQ62267 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sprr1bQ62267 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sprr1bQ62267 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sprr1bQ62267 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sprr1bQ62267 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sprr1bQ62267 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sprr1bQ62267 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sprr1bQ62267 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sprr1bQ62267 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sprr1bQ62267 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sprr1bQ62267 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sprr1bQ62267 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sprr1bQ62267 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sprr1bQ62267 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sprr1bQ62267 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sprr1bQ62267 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sprr1bQ62267 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sprr1bQ62267 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sprr1bQ62267 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sprr1bQ62267 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sprr1bQ62267 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sprr1bQ62267 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sprr1bQ62267 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sprr1bQ62267 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sprr1bQ62267 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sprr1bQ62267 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sprr1bQ62267 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sprr1bQ62267 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sprr1bQ62267 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sprr1bQ62267 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sprr1bQ62267 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sprr1bQ62267 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Sprr1bQ62267 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sprr1bQ62267 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sprr1bQ62267 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sprr1bQ62267 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sprr1bQ62267 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sprr1bQ62267 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sprr1bQ62267 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sprr1bQ62267 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sprr1bQ62267 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sprr1bQ62267 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Sprr1bQ62267 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sprr1bQ62267 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Sprr1bQ62267 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sprr1bQ62267 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sprr1bQ62267 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sprr1bQ62267 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sprr1bQ62267 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sprr1bQ62267 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sprr1bQ62267 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sprr1bQ62267 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sprr1bQ62267 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sprr1bQ62267 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sprr1bQ62267 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sprr1bQ62267 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sprr1bQ62267 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sprr1bQ62267 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sprr1bQ62267 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sprr1bQ62267 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sprr1bQ62267 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sprr1bQ62267 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Sprr1bQ62267 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sprr1bQ62267 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sprr1bQ62267 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sprr1bQ62267 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sprr1bQ62267 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sprr1bQ62267 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sprr1bQ62267 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sprr1bQ62267 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sprr1bQ62267 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sprr1bQ62267 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sprr1bQ62267 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sprr1bQ62267 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sprr1bQ62267 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sprr1bQ62267 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sprr1bQ62267 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sprr1bQ62267 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sprr1bQ62267 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sprr1bQ62267 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sprr1bQ62267 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sprr1bQ62267 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sprr1bQ62267 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sprr1bQ62267 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sprr1bQ62267 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sprr1bQ62267 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sprr1bQ62267 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sprr1bQ62267 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sprr1bQ62267 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sprr1bQ62267 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sprr1bQ62267 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sprr1bQ62267 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms