Protein–RNA interactions for Protein: Q62241

Snrpc, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpcQ62241 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SnrpcQ62241 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SnrpcQ62241 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SnrpcQ62241 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SnrpcQ62241 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SnrpcQ62241 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SnrpcQ62241 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SnrpcQ62241 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SnrpcQ62241 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SnrpcQ62241 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SnrpcQ62241 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SnrpcQ62241 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SnrpcQ62241 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SnrpcQ62241 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SnrpcQ62241 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SnrpcQ62241 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SnrpcQ62241 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SnrpcQ62241 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SnrpcQ62241 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SnrpcQ62241 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SnrpcQ62241 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SnrpcQ62241 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SnrpcQ62241 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SnrpcQ62241 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SnrpcQ62241 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SnrpcQ62241 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SnrpcQ62241 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SnrpcQ62241 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SnrpcQ62241 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SnrpcQ62241 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SnrpcQ62241 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SnrpcQ62241 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SnrpcQ62241 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SnrpcQ62241 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SnrpcQ62241 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SnrpcQ62241 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SnrpcQ62241 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SnrpcQ62241 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SnrpcQ62241 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SnrpcQ62241 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SnrpcQ62241 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SnrpcQ62241 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SnrpcQ62241 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SnrpcQ62241 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SnrpcQ62241 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SnrpcQ62241 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SnrpcQ62241 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SnrpcQ62241 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SnrpcQ62241 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SnrpcQ62241 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SnrpcQ62241 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SnrpcQ62241 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SnrpcQ62241 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SnrpcQ62241 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SnrpcQ62241 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SnrpcQ62241 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SnrpcQ62241 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SnrpcQ62241 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SnrpcQ62241 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SnrpcQ62241 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SnrpcQ62241 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SnrpcQ62241 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SnrpcQ62241 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SnrpcQ62241 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SnrpcQ62241 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SnrpcQ62241 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SnrpcQ62241 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SnrpcQ62241 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SnrpcQ62241 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SnrpcQ62241 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SnrpcQ62241 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SnrpcQ62241 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SnrpcQ62241 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SnrpcQ62241 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SnrpcQ62241 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SnrpcQ62241 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SnrpcQ62241 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SnrpcQ62241 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SnrpcQ62241 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SnrpcQ62241 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SnrpcQ62241 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SnrpcQ62241 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SnrpcQ62241 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SnrpcQ62241 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SnrpcQ62241 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SnrpcQ62241 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SnrpcQ62241 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SnrpcQ62241 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SnrpcQ62241 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SnrpcQ62241 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SnrpcQ62241 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SnrpcQ62241 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SnrpcQ62241 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SnrpcQ62241 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SnrpcQ62241 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SnrpcQ62241 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SnrpcQ62241 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SnrpcQ62241 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SnrpcQ62241 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SnrpcQ62241 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms