Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sycp1Q62209 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Sycp1Q62209 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Sycp1Q62209 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Sycp1Q62209 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sycp1Q62209 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sycp1Q62209 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sycp1Q62209 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sycp1Q62209 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Sycp1Q62209 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Sycp1Q62209 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Sycp1Q62209 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sycp1Q62209 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sycp1Q62209 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sycp1Q62209 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Sycp1Q62209 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Sycp1Q62209 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sycp1Q62209 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sycp1Q62209 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sycp1Q62209 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sycp1Q62209 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sycp1Q62209 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Sycp1Q62209 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Sycp1Q62209 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sycp1Q62209 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sycp1Q62209 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sycp1Q62209 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Sycp1Q62209 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sycp1Q62209 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sycp1Q62209 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sycp1Q62209 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sycp1Q62209 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Sycp1Q62209 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Sycp1Q62209 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Sycp1Q62209 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sycp1Q62209 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sycp1Q62209 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sycp1Q62209 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sycp1Q62209 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sycp1Q62209 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Sycp1Q62209 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sycp1Q62209 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sycp1Q62209 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sycp1Q62209 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sycp1Q62209 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sycp1Q62209 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sycp1Q62209 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sycp1Q62209 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sycp1Q62209 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sycp1Q62209 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sycp1Q62209 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Sycp1Q62209 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sycp1Q62209 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sycp1Q62209 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sycp1Q62209 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sycp1Q62209 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sycp1Q62209 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sycp1Q62209 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sycp1Q62209 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sycp1Q62209 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sycp1Q62209 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sycp1Q62209 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Sycp1Q62209 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sycp1Q62209 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sycp1Q62209 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sycp1Q62209 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sycp1Q62209 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Sycp1Q62209 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Sycp1Q62209 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Sycp1Q62209 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Sycp1Q62209 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sycp1Q62209 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sycp1Q62209 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sycp1Q62209 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sycp1Q62209 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sycp1Q62209 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Sycp1Q62209 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sycp1Q62209 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sycp1Q62209 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sycp1Q62209 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sycp1Q62209 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sycp1Q62209 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sycp1Q62209 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sycp1Q62209 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sycp1Q62209 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sycp1Q62209 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sycp1Q62209 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sycp1Q62209 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sycp1Q62209 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.55■■■□□ 2
Sycp1Q62209 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Sycp1Q62209 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Sycp1Q62209 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Sycp1Q62209 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sycp1Q62209 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sycp1Q62209 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sycp1Q62209 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sycp1Q62209 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sycp1Q62209 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sycp1Q62209 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sycp1Q62209 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms