Protein–RNA interactions for Protein: Q62177

Sema3b, Semaphorin-3B, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3bQ62177 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sema3bQ62177 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sema3bQ62177 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sema3bQ62177 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sema3bQ62177 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sema3bQ62177 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sema3bQ62177 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sema3bQ62177 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sema3bQ62177 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sema3bQ62177 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sema3bQ62177 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Sema3bQ62177 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sema3bQ62177 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Sema3bQ62177 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sema3bQ62177 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Sema3bQ62177 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sema3bQ62177 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sema3bQ62177 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sema3bQ62177 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sema3bQ62177 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sema3bQ62177 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sema3bQ62177 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sema3bQ62177 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sema3bQ62177 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Sema3bQ62177 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sema3bQ62177 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Sema3bQ62177 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sema3bQ62177 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sema3bQ62177 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sema3bQ62177 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sema3bQ62177 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sema3bQ62177 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sema3bQ62177 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sema3bQ62177 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sema3bQ62177 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sema3bQ62177 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Sema3bQ62177 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sema3bQ62177 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sema3bQ62177 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sema3bQ62177 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Sema3bQ62177 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sema3bQ62177 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sema3bQ62177 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sema3bQ62177 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sema3bQ62177 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sema3bQ62177 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sema3bQ62177 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Sema3bQ62177 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sema3bQ62177 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sema3bQ62177 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sema3bQ62177 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sema3bQ62177 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sema3bQ62177 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sema3bQ62177 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sema3bQ62177 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sema3bQ62177 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sema3bQ62177 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sema3bQ62177 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sema3bQ62177 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sema3bQ62177 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sema3bQ62177 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sema3bQ62177 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sema3bQ62177 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sema3bQ62177 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sema3bQ62177 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sema3bQ62177 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sema3bQ62177 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sema3bQ62177 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sema3bQ62177 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sema3bQ62177 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sema3bQ62177 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sema3bQ62177 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Sema3bQ62177 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sema3bQ62177 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Sema3bQ62177 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sema3bQ62177 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sema3bQ62177 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sema3bQ62177 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Sema3bQ62177 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sema3bQ62177 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sema3bQ62177 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sema3bQ62177 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sema3bQ62177 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sema3bQ62177 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sema3bQ62177 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sema3bQ62177 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sema3bQ62177 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sema3bQ62177 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sema3bQ62177 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sema3bQ62177 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Sema3bQ62177 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sema3bQ62177 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sema3bQ62177 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sema3bQ62177 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sema3bQ62177 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sema3bQ62177 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sema3bQ62177 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sema3bQ62177 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sema3bQ62177 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sema3bQ62177 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms