Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rbm38Q62176 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbm38Q62176 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbm38Q62176 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbm38Q62176 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rbm38Q62176 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rbm38Q62176 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rbm38Q62176 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rbm38Q62176 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rbm38Q62176 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rbm38Q62176 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rbm38Q62176 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rbm38Q62176 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rbm38Q62176 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rbm38Q62176 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rbm38Q62176 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rbm38Q62176 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rbm38Q62176 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rbm38Q62176 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rbm38Q62176 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rbm38Q62176 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rbm38Q62176 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rbm38Q62176 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rbm38Q62176 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rbm38Q62176 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rbm38Q62176 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rbm38Q62176 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rbm38Q62176 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rbm38Q62176 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rbm38Q62176 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rbm38Q62176 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rbm38Q62176 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rbm38Q62176 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rbm38Q62176 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rbm38Q62176 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rbm38Q62176 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rbm38Q62176 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rbm38Q62176 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rbm38Q62176 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rbm38Q62176 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rbm38Q62176 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rbm38Q62176 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rbm38Q62176 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rbm38Q62176 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rbm38Q62176 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rbm38Q62176 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Rbm38Q62176 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rbm38Q62176 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rbm38Q62176 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rbm38Q62176 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rbm38Q62176 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rbm38Q62176 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rbm38Q62176 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rbm38Q62176 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rbm38Q62176 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rbm38Q62176 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rbm38Q62176 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rbm38Q62176 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rbm38Q62176 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rbm38Q62176 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rbm38Q62176 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rbm38Q62176 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rbm38Q62176 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rbm38Q62176 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rbm38Q62176 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rbm38Q62176 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rbm38Q62176 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rbm38Q62176 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rbm38Q62176 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rbm38Q62176 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rbm38Q62176 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rbm38Q62176 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rbm38Q62176 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rbm38Q62176 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rbm38Q62176 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rbm38Q62176 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rbm38Q62176 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rbm38Q62176 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rbm38Q62176 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rbm38Q62176 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rbm38Q62176 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Rbm38Q62176 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rbm38Q62176 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rbm38Q62176 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rbm38Q62176 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rbm38Q62176 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rbm38Q62176 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rbm38Q62176 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rbm38Q62176 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rbm38Q62176 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rbm38Q62176 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Rbm38Q62176 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rbm38Q62176 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rbm38Q62176 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rbm38Q62176 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rbm38Q62176 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rbm38Q62176 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rbm38Q62176 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rbm38Q62176 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rbm38Q62176 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
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