Protein–RNA interactions for Protein: Q61553

Fscn1, Fascin, mousemouse

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fscn1Q61553 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Fscn1Q61553 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Fscn1Q61553 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Fscn1Q61553 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Fscn1Q61553 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Fscn1Q61553 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Fscn1Q61553 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
Fscn1Q61553 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Fscn1Q61553 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Fscn1Q61553 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Fscn1Q61553 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Fscn1Q61553 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Fscn1Q61553 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Fscn1Q61553 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Fscn1Q61553 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Fscn1Q61553 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Fscn1Q61553 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Fscn1Q61553 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Fscn1Q61553 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Fscn1Q61553 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Fscn1Q61553 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Fscn1Q61553 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Fscn1Q61553 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Fscn1Q61553 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Fscn1Q61553 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Fscn1Q61553 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Fscn1Q61553 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Fscn1Q61553 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Fscn1Q61553 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Fscn1Q61553 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Fscn1Q61553 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Fscn1Q61553 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Fscn1Q61553 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Fscn1Q61553 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Fscn1Q61553 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Fscn1Q61553 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Fscn1Q61553 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Fscn1Q61553 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fscn1Q61553 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fscn1Q61553 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fscn1Q61553 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fscn1Q61553 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Fscn1Q61553 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Fscn1Q61553 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Fscn1Q61553 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Fscn1Q61553 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Fscn1Q61553 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Fscn1Q61553 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Fscn1Q61553 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Fscn1Q61553 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Fscn1Q61553 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Fscn1Q61553 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Fscn1Q61553 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Fscn1Q61553 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Fscn1Q61553 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Fscn1Q61553 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Fscn1Q61553 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Fscn1Q61553 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Fscn1Q61553 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Fscn1Q61553 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Fscn1Q61553 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Fscn1Q61553 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Fscn1Q61553 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Fscn1Q61553 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Fscn1Q61553 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fscn1Q61553 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Fscn1Q61553 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Fscn1Q61553 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Fscn1Q61553 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Fscn1Q61553 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Fscn1Q61553 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Fscn1Q61553 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Fscn1Q61553 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Fscn1Q61553 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Fscn1Q61553 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Fscn1Q61553 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Fscn1Q61553 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Fscn1Q61553 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Fscn1Q61553 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Fscn1Q61553 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Fscn1Q61553 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Fscn1Q61553 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Fscn1Q61553 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Fscn1Q61553 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Fscn1Q61553 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Fscn1Q61553 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Fscn1Q61553 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Fscn1Q61553 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Fscn1Q61553 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Fscn1Q61553 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Fscn1Q61553 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Fscn1Q61553 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Fscn1Q61553 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Fscn1Q61553 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Fscn1Q61553 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Fscn1Q61553 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Fscn1Q61553 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Fscn1Q61553 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Fscn1Q61553 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Fscn1Q61553 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms