Protein–RNA interactions for Protein: Q61476

Cd55b, Complement decay-accelerating factor transmembrane isoform, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd55bQ61476 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd55bQ61476 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd55bQ61476 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd55bQ61476 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd55bQ61476 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd55bQ61476 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd55bQ61476 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd55bQ61476 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd55bQ61476 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd55bQ61476 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd55bQ61476 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd55bQ61476 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd55bQ61476 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd55bQ61476 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd55bQ61476 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd55bQ61476 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd55bQ61476 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd55bQ61476 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd55bQ61476 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd55bQ61476 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cd55bQ61476 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd55bQ61476 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd55bQ61476 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd55bQ61476 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd55bQ61476 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd55bQ61476 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cd55bQ61476 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd55bQ61476 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd55bQ61476 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd55bQ61476 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd55bQ61476 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd55bQ61476 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cd55bQ61476 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd55bQ61476 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd55bQ61476 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd55bQ61476 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd55bQ61476 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd55bQ61476 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd55bQ61476 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd55bQ61476 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd55bQ61476 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd55bQ61476 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd55bQ61476 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd55bQ61476 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd55bQ61476 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cd55bQ61476 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cd55bQ61476 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd55bQ61476 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd55bQ61476 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd55bQ61476 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd55bQ61476 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd55bQ61476 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cd55bQ61476 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd55bQ61476 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd55bQ61476 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd55bQ61476 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cd55bQ61476 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cd55bQ61476 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Cd55bQ61476 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cd55bQ61476 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cd55bQ61476 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cd55bQ61476 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cd55bQ61476 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cd55bQ61476 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cd55bQ61476 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cd55bQ61476 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cd55bQ61476 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cd55bQ61476 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cd55bQ61476 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cd55bQ61476 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cd55bQ61476 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cd55bQ61476 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cd55bQ61476 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cd55bQ61476 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cd55bQ61476 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cd55bQ61476 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cd55bQ61476 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cd55bQ61476 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cd55bQ61476 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Cd55bQ61476 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cd55bQ61476 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cd55bQ61476 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cd55bQ61476 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cd55bQ61476 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cd55bQ61476 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cd55bQ61476 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cd55bQ61476 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cd55bQ61476 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cd55bQ61476 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cd55bQ61476 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cd55bQ61476 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Cd55bQ61476 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cd55bQ61476 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cd55bQ61476 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cd55bQ61476 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cd55bQ61476 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cd55bQ61476 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cd55bQ61476 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cd55bQ61476 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cd55bQ61476 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.9 ms