Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Ccne1Q61457 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Ccne1Q61457 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Ccne1Q61457 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Ccne1Q61457 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
Ccne1Q61457 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Ccne1Q61457 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Ccne1Q61457 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Ccne1Q61457 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Ccne1Q61457 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Ccne1Q61457 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Ccne1Q61457 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Ccne1Q61457 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Ccne1Q61457 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Ccne1Q61457 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Ccne1Q61457 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Ccne1Q61457 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Ccne1Q61457 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Ccne1Q61457 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
Ccne1Q61457 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Ccne1Q61457 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Ccne1Q61457 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Ccne1Q61457 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Ccne1Q61457 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Ccne1Q61457 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Ccne1Q61457 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Ccne1Q61457 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Ccne1Q61457 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Ccne1Q61457 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Ccne1Q61457 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Ccne1Q61457 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Ccne1Q61457 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Ccne1Q61457 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Ccne1Q61457 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Ccne1Q61457 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC33.77■■■■□ 3
Ccne1Q61457 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC33.77■■■■□ 3
Ccne1Q61457 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
Ccne1Q61457 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
Ccne1Q61457 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Ccne1Q61457 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Ccne1Q61457 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Ccne1Q61457 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Ccne1Q61457 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Ccne1Q61457 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Ccne1Q61457 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Ccne1Q61457 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Ccne1Q61457 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Ccne1Q61457 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Ccne1Q61457 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Ccne1Q61457 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Ccne1Q61457 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Ccne1Q61457 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Ccne1Q61457 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Ccne1Q61457 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Ccne1Q61457 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Ccne1Q61457 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
Ccne1Q61457 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Ccne1Q61457 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Ccne1Q61457 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Ccne1Q61457 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Ccne1Q61457 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Ccne1Q61457 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Ccne1Q61457 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Ccne1Q61457 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
Ccne1Q61457 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Ccne1Q61457 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Ccne1Q61457 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Ccne1Q61457 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Ccne1Q61457 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Ccne1Q61457 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Ccne1Q61457 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Ccne1Q61457 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Ccne1Q61457 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Ccne1Q61457 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Ccne1Q61457 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
Ccne1Q61457 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Ccne1Q61457 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Ccne1Q61457 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
Ccne1Q61457 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Ccne1Q61457 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Ccne1Q61457 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Ccne1Q61457 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Ccne1Q61457 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
Ccne1Q61457 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ccne1Q61457 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ccne1Q61457 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
Ccne1Q61457 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Ccne1Q61457 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
Ccne1Q61457 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Ccne1Q61457 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
Ccne1Q61457 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Ccne1Q61457 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Ccne1Q61457 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Ccne1Q61457 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Ccne1Q61457 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Ccne1Q61457 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Ccne1Q61457 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Ccne1Q61457 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Ccne1Q61457 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Ccne1Q61457 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.5 ms