Protein–RNA interactions for Protein: Q61301

Ctnna2, Catenin alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna2Q61301 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Ctnna2Q61301 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ctnna2Q61301 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ctnna2Q61301 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ctnna2Q61301 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ctnna2Q61301 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ctnna2Q61301 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ctnna2Q61301 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ctnna2Q61301 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ctnna2Q61301 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ctnna2Q61301 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ctnna2Q61301 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ctnna2Q61301 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Ctnna2Q61301 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ctnna2Q61301 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ctnna2Q61301 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ctnna2Q61301 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ctnna2Q61301 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ctnna2Q61301 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ctnna2Q61301 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ctnna2Q61301 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ctnna2Q61301 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ctnna2Q61301 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Ctnna2Q61301 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ctnna2Q61301 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ctnna2Q61301 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ctnna2Q61301 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ctnna2Q61301 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ctnna2Q61301 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ctnna2Q61301 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ctnna2Q61301 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ctnna2Q61301 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ctnna2Q61301 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Ctnna2Q61301 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ctnna2Q61301 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ctnna2Q61301 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ctnna2Q61301 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ctnna2Q61301 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Ctnna2Q61301 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ctnna2Q61301 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ctnna2Q61301 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ctnna2Q61301 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ctnna2Q61301 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ctnna2Q61301 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ctnna2Q61301 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ctnna2Q61301 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ctnna2Q61301 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ctnna2Q61301 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ctnna2Q61301 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ctnna2Q61301 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ctnna2Q61301 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ctnna2Q61301 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Ctnna2Q61301 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ctnna2Q61301 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ctnna2Q61301 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ctnna2Q61301 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ctnna2Q61301 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Ctnna2Q61301 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Ctnna2Q61301 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Ctnna2Q61301 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ctnna2Q61301 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ctnna2Q61301 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ctnna2Q61301 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ctnna2Q61301 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ctnna2Q61301 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ctnna2Q61301 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ctnna2Q61301 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ctnna2Q61301 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ctnna2Q61301 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Ctnna2Q61301 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ctnna2Q61301 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ctnna2Q61301 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ctnna2Q61301 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ctnna2Q61301 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ctnna2Q61301 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ctnna2Q61301 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ctnna2Q61301 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ctnna2Q61301 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ctnna2Q61301 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ctnna2Q61301 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ctnna2Q61301 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ctnna2Q61301 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ctnna2Q61301 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ctnna2Q61301 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ctnna2Q61301 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ctnna2Q61301 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ctnna2Q61301 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ctnna2Q61301 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ctnna2Q61301 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ctnna2Q61301 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ctnna2Q61301 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ctnna2Q61301 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ctnna2Q61301 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ctnna2Q61301 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ctnna2Q61301 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ctnna2Q61301 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ctnna2Q61301 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Ctnna2Q61301 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ctnna2Q61301 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ctnna2Q61301 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms