Protein–RNA interactions for Protein: Q61216

Mre11, Double-strand break repair protein MRE11, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mre11Q61216 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Mre11Q61216 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Mre11Q61216 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Mre11Q61216 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Mre11Q61216 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Mre11Q61216 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Mre11Q61216 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
Mre11Q61216 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Mre11Q61216 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Mre11Q61216 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Mre11Q61216 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Mre11Q61216 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Mre11Q61216 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Mre11Q61216 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Mre11Q61216 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Mre11Q61216 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Mre11Q61216 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Mre11Q61216 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.44
Mre11Q61216 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Mre11Q61216 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Mre11Q61216 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
Mre11Q61216 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Mre11Q61216 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Mre11Q61216 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Mre11Q61216 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Mre11Q61216 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Mre11Q61216 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Mre11Q61216 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Mre11Q61216 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Mre11Q61216 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Mre11Q61216 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Mre11Q61216 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Mre11Q61216 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Mre11Q61216 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Mre11Q61216 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Mre11Q61216 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Mre11Q61216 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Mre11Q61216 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Mre11Q61216 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Mre11Q61216 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Mre11Q61216 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Mre11Q61216 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Mre11Q61216 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Mre11Q61216 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Mre11Q61216 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Mre11Q61216 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Mre11Q61216 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Mre11Q61216 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Mre11Q61216 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Mre11Q61216 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Mre11Q61216 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Mre11Q61216 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Mre11Q61216 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Mre11Q61216 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Mre11Q61216 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Mre11Q61216 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Mre11Q61216 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Mre11Q61216 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Mre11Q61216 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Mre11Q61216 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
Mre11Q61216 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Mre11Q61216 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Mre11Q61216 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Mre11Q61216 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Mre11Q61216 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Mre11Q61216 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Mre11Q61216 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Mre11Q61216 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Mre11Q61216 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Mre11Q61216 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Mre11Q61216 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Mre11Q61216 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Mre11Q61216 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Mre11Q61216 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Mre11Q61216 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Mre11Q61216 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Mre11Q61216 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Mre11Q61216 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Mre11Q61216 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Mre11Q61216 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Mre11Q61216 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Mre11Q61216 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Mre11Q61216 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Mre11Q61216 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Mre11Q61216 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Mre11Q61216 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Mre11Q61216 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Mre11Q61216 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Mre11Q61216 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Mre11Q61216 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.36
Mre11Q61216 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Mre11Q61216 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Mre11Q61216 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Mre11Q61216 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Mre11Q61216 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Mre11Q61216 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Mre11Q61216 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Mre11Q61216 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Mre11Q61216 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Mre11Q61216 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms