Protein–RNA interactions for Protein: Q60I26

Als2cl, ALS2 C-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 952 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Als2clQ60I26 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Als2clQ60I26 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Als2clQ60I26 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Als2clQ60I26 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Als2clQ60I26 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Als2clQ60I26 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Als2clQ60I26 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Als2clQ60I26 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Als2clQ60I26 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Als2clQ60I26 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Als2clQ60I26 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Als2clQ60I26 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Als2clQ60I26 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Als2clQ60I26 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Als2clQ60I26 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Als2clQ60I26 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Als2clQ60I26 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Als2clQ60I26 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Als2clQ60I26 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Als2clQ60I26 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Als2clQ60I26 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Als2clQ60I26 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Als2clQ60I26 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Als2clQ60I26 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Als2clQ60I26 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Als2clQ60I26 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Als2clQ60I26 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Als2clQ60I26 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Als2clQ60I26 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Als2clQ60I26 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Als2clQ60I26 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Als2clQ60I26 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Als2clQ60I26 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Als2clQ60I26 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Als2clQ60I26 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Als2clQ60I26 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Als2clQ60I26 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Als2clQ60I26 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Als2clQ60I26 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Als2clQ60I26 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Als2clQ60I26 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Als2clQ60I26 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Als2clQ60I26 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Als2clQ60I26 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Als2clQ60I26 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Als2clQ60I26 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Als2clQ60I26 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Als2clQ60I26 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Als2clQ60I26 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Als2clQ60I26 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Als2clQ60I26 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Als2clQ60I26 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Als2clQ60I26 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Als2clQ60I26 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Als2clQ60I26 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Als2clQ60I26 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Als2clQ60I26 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Als2clQ60I26 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Als2clQ60I26 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Als2clQ60I26 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Als2clQ60I26 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Als2clQ60I26 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Als2clQ60I26 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Als2clQ60I26 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Als2clQ60I26 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Als2clQ60I26 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Als2clQ60I26 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Als2clQ60I26 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Als2clQ60I26 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Als2clQ60I26 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Als2clQ60I26 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Als2clQ60I26 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Als2clQ60I26 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Als2clQ60I26 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Als2clQ60I26 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Als2clQ60I26 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Als2clQ60I26 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Als2clQ60I26 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Als2clQ60I26 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Als2clQ60I26 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Als2clQ60I26 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Als2clQ60I26 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Als2clQ60I26 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Als2clQ60I26 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Als2clQ60I26 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Als2clQ60I26 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Als2clQ60I26 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Als2clQ60I26 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Als2clQ60I26 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Als2clQ60I26 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Als2clQ60I26 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Als2clQ60I26 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Als2clQ60I26 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Als2clQ60I26 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Als2clQ60I26 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Als2clQ60I26 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Als2clQ60I26 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Als2clQ60I26 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Als2clQ60I26 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Als2clQ60I26 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms