Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Csnk2a1Q60737 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Csnk2a1Q60737 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Csnk2a1Q60737 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Csnk2a1Q60737 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Csnk2a1Q60737 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Csnk2a1Q60737 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Csnk2a1Q60737 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Csnk2a1Q60737 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Csnk2a1Q60737 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Csnk2a1Q60737 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Csnk2a1Q60737 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Csnk2a1Q60737 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Csnk2a1Q60737 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Csnk2a1Q60737 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Csnk2a1Q60737 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Csnk2a1Q60737 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Csnk2a1Q60737 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Csnk2a1Q60737 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Csnk2a1Q60737 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Csnk2a1Q60737 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Csnk2a1Q60737 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Csnk2a1Q60737 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Csnk2a1Q60737 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Csnk2a1Q60737 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Csnk2a1Q60737 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Csnk2a1Q60737 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Csnk2a1Q60737 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Csnk2a1Q60737 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Csnk2a1Q60737 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Csnk2a1Q60737 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Csnk2a1Q60737 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Csnk2a1Q60737 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Csnk2a1Q60737 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Csnk2a1Q60737 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Csnk2a1Q60737 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Csnk2a1Q60737 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Csnk2a1Q60737 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Csnk2a1Q60737 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Csnk2a1Q60737 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Csnk2a1Q60737 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Csnk2a1Q60737 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Csnk2a1Q60737 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Csnk2a1Q60737 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Csnk2a1Q60737 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Csnk2a1Q60737 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Csnk2a1Q60737 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Csnk2a1Q60737 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Csnk2a1Q60737 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Csnk2a1Q60737 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Csnk2a1Q60737 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Csnk2a1Q60737 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Csnk2a1Q60737 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Csnk2a1Q60737 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Csnk2a1Q60737 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Csnk2a1Q60737 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Csnk2a1Q60737 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Csnk2a1Q60737 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Csnk2a1Q60737 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Csnk2a1Q60737 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Csnk2a1Q60737 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Csnk2a1Q60737 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Csnk2a1Q60737 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Csnk2a1Q60737 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Csnk2a1Q60737 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Csnk2a1Q60737 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Csnk2a1Q60737 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Csnk2a1Q60737 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Csnk2a1Q60737 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Csnk2a1Q60737 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Csnk2a1Q60737 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Csnk2a1Q60737 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Csnk2a1Q60737 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Csnk2a1Q60737 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Csnk2a1Q60737 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Csnk2a1Q60737 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csnk2a1Q60737 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csnk2a1Q60737 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csnk2a1Q60737 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Csnk2a1Q60737 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Csnk2a1Q60737 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Csnk2a1Q60737 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Csnk2a1Q60737 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Csnk2a1Q60737 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Csnk2a1Q60737 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Csnk2a1Q60737 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Csnk2a1Q60737 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Csnk2a1Q60737 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Csnk2a1Q60737 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Csnk2a1Q60737 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Csnk2a1Q60737 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Csnk2a1Q60737 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Csnk2a1Q60737 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Csnk2a1Q60737 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Csnk2a1Q60737 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Csnk2a1Q60737 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Csnk2a1Q60737 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Csnk2a1Q60737 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Csnk2a1Q60737 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Csnk2a1Q60737 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms