Protein–RNA interactions for Protein: Q60692

Psmb6, Proteasome subunit beta type-6, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb6Q60692 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psmb6Q60692 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psmb6Q60692 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psmb6Q60692 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Psmb6Q60692 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psmb6Q60692 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psmb6Q60692 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psmb6Q60692 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psmb6Q60692 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psmb6Q60692 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Psmb6Q60692 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Psmb6Q60692 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Psmb6Q60692 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Psmb6Q60692 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psmb6Q60692 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psmb6Q60692 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psmb6Q60692 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psmb6Q60692 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psmb6Q60692 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psmb6Q60692 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Psmb6Q60692 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Psmb6Q60692 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Psmb6Q60692 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Psmb6Q60692 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Psmb6Q60692 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Psmb6Q60692 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Psmb6Q60692 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Psmb6Q60692 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Psmb6Q60692 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Psmb6Q60692 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Psmb6Q60692 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Psmb6Q60692 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Psmb6Q60692 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Psmb6Q60692 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Psmb6Q60692 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Psmb6Q60692 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Psmb6Q60692 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Psmb6Q60692 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Psmb6Q60692 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Psmb6Q60692 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Psmb6Q60692 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Psmb6Q60692 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Psmb6Q60692 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Psmb6Q60692 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Psmb6Q60692 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Psmb6Q60692 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Psmb6Q60692 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Psmb6Q60692 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Psmb6Q60692 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Psmb6Q60692 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Psmb6Q60692 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Psmb6Q60692 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Psmb6Q60692 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psmb6Q60692 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Psmb6Q60692 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Psmb6Q60692 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Psmb6Q60692 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Psmb6Q60692 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Psmb6Q60692 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Psmb6Q60692 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Psmb6Q60692 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Psmb6Q60692 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Psmb6Q60692 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Psmb6Q60692 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Psmb6Q60692 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Psmb6Q60692 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Psmb6Q60692 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Psmb6Q60692 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Psmb6Q60692 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Psmb6Q60692 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Psmb6Q60692 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Psmb6Q60692 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Psmb6Q60692 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Psmb6Q60692 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Psmb6Q60692 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Psmb6Q60692 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Psmb6Q60692 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Psmb6Q60692 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Psmb6Q60692 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Psmb6Q60692 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Psmb6Q60692 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Psmb6Q60692 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Psmb6Q60692 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Psmb6Q60692 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Psmb6Q60692 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Psmb6Q60692 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Psmb6Q60692 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Psmb6Q60692 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Psmb6Q60692 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Psmb6Q60692 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Psmb6Q60692 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Psmb6Q60692 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Psmb6Q60692 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Psmb6Q60692 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Psmb6Q60692 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Psmb6Q60692 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Psmb6Q60692 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Psmb6Q60692 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Psmb6Q60692 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Psmb6Q60692 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms