Protein–RNA interactions for Protein: Q60668

Hnrnpd, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D0, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HnrnpdQ60668 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HnrnpdQ60668 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HnrnpdQ60668 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HnrnpdQ60668 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HnrnpdQ60668 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HnrnpdQ60668 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
HnrnpdQ60668 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
HnrnpdQ60668 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HnrnpdQ60668 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HnrnpdQ60668 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HnrnpdQ60668 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HnrnpdQ60668 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HnrnpdQ60668 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HnrnpdQ60668 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HnrnpdQ60668 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HnrnpdQ60668 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HnrnpdQ60668 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HnrnpdQ60668 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HnrnpdQ60668 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HnrnpdQ60668 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HnrnpdQ60668 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HnrnpdQ60668 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
HnrnpdQ60668 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
HnrnpdQ60668 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HnrnpdQ60668 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HnrnpdQ60668 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HnrnpdQ60668 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HnrnpdQ60668 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HnrnpdQ60668 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HnrnpdQ60668 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HnrnpdQ60668 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HnrnpdQ60668 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HnrnpdQ60668 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HnrnpdQ60668 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HnrnpdQ60668 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HnrnpdQ60668 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HnrnpdQ60668 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HnrnpdQ60668 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HnrnpdQ60668 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HnrnpdQ60668 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
HnrnpdQ60668 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HnrnpdQ60668 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HnrnpdQ60668 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HnrnpdQ60668 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HnrnpdQ60668 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HnrnpdQ60668 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HnrnpdQ60668 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HnrnpdQ60668 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HnrnpdQ60668 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HnrnpdQ60668 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HnrnpdQ60668 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HnrnpdQ60668 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HnrnpdQ60668 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HnrnpdQ60668 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HnrnpdQ60668 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HnrnpdQ60668 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HnrnpdQ60668 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HnrnpdQ60668 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HnrnpdQ60668 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HnrnpdQ60668 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HnrnpdQ60668 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
HnrnpdQ60668 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HnrnpdQ60668 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HnrnpdQ60668 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
HnrnpdQ60668 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HnrnpdQ60668 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HnrnpdQ60668 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HnrnpdQ60668 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HnrnpdQ60668 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
HnrnpdQ60668 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HnrnpdQ60668 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HnrnpdQ60668 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HnrnpdQ60668 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HnrnpdQ60668 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HnrnpdQ60668 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HnrnpdQ60668 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HnrnpdQ60668 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HnrnpdQ60668 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
HnrnpdQ60668 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HnrnpdQ60668 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HnrnpdQ60668 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HnrnpdQ60668 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HnrnpdQ60668 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HnrnpdQ60668 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HnrnpdQ60668 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
HnrnpdQ60668 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
HnrnpdQ60668 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HnrnpdQ60668 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HnrnpdQ60668 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HnrnpdQ60668 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HnrnpdQ60668 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HnrnpdQ60668 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HnrnpdQ60668 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HnrnpdQ60668 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HnrnpdQ60668 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HnrnpdQ60668 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HnrnpdQ60668 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HnrnpdQ60668 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HnrnpdQ60668 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HnrnpdQ60668 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms