Protein–RNA interactions for Protein: Q60595

Xlr3a, X-linked lymphocyte-regulated protein 3A, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xlr3aQ60595 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Xlr3aQ60595 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Xlr3aQ60595 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Xlr3aQ60595 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Xlr3aQ60595 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Xlr3aQ60595 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Xlr3aQ60595 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Xlr3aQ60595 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Xlr3aQ60595 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Xlr3aQ60595 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Xlr3aQ60595 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Xlr3aQ60595 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Xlr3aQ60595 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Xlr3aQ60595 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Xlr3aQ60595 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Xlr3aQ60595 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Xlr3aQ60595 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Xlr3aQ60595 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Xlr3aQ60595 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Xlr3aQ60595 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Xlr3aQ60595 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Xlr3aQ60595 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Xlr3aQ60595 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Xlr3aQ60595 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Xlr3aQ60595 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Xlr3aQ60595 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Xlr3aQ60595 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Xlr3aQ60595 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Xlr3aQ60595 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Xlr3aQ60595 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Xlr3aQ60595 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Xlr3aQ60595 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Xlr3aQ60595 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Xlr3aQ60595 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Xlr3aQ60595 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Xlr3aQ60595 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Xlr3aQ60595 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Xlr3aQ60595 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Xlr3aQ60595 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Xlr3aQ60595 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Xlr3aQ60595 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Xlr3aQ60595 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Xlr3aQ60595 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Xlr3aQ60595 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Xlr3aQ60595 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Xlr3aQ60595 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Xlr3aQ60595 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Xlr3aQ60595 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Xlr3aQ60595 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Xlr3aQ60595 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Xlr3aQ60595 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Xlr3aQ60595 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Xlr3aQ60595 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Xlr3aQ60595 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Xlr3aQ60595 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Xlr3aQ60595 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Xlr3aQ60595 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Xlr3aQ60595 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Xlr3aQ60595 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Xlr3aQ60595 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Xlr3aQ60595 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Xlr3aQ60595 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Xlr3aQ60595 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Xlr3aQ60595 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Xlr3aQ60595 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Xlr3aQ60595 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Xlr3aQ60595 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Xlr3aQ60595 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Xlr3aQ60595 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Xlr3aQ60595 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Xlr3aQ60595 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Xlr3aQ60595 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Xlr3aQ60595 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Xlr3aQ60595 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Xlr3aQ60595 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Xlr3aQ60595 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Xlr3aQ60595 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Xlr3aQ60595 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Xlr3aQ60595 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Xlr3aQ60595 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Xlr3aQ60595 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Xlr3aQ60595 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Xlr3aQ60595 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Xlr3aQ60595 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Xlr3aQ60595 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Xlr3aQ60595 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Xlr3aQ60595 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Xlr3aQ60595 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Xlr3aQ60595 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Xlr3aQ60595 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Xlr3aQ60595 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Xlr3aQ60595 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Xlr3aQ60595 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Xlr3aQ60595 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Xlr3aQ60595 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Xlr3aQ60595 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Xlr3aQ60595 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Xlr3aQ60595 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Xlr3aQ60595 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Xlr3aQ60595 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.9 ms