Protein–RNA interactions for Protein: Q5XFR0

Pabpn1l, Embryonic polyadenylate-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpn1lQ5XFR0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pabpn1lQ5XFR0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Pabpn1lQ5XFR0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pabpn1lQ5XFR0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pabpn1lQ5XFR0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pabpn1lQ5XFR0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pabpn1lQ5XFR0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Pabpn1lQ5XFR0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pabpn1lQ5XFR0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pabpn1lQ5XFR0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pabpn1lQ5XFR0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pabpn1lQ5XFR0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pabpn1lQ5XFR0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pabpn1lQ5XFR0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pabpn1lQ5XFR0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pabpn1lQ5XFR0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pabpn1lQ5XFR0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pabpn1lQ5XFR0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pabpn1lQ5XFR0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pabpn1lQ5XFR0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pabpn1lQ5XFR0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pabpn1lQ5XFR0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pabpn1lQ5XFR0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pabpn1lQ5XFR0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pabpn1lQ5XFR0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pabpn1lQ5XFR0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pabpn1lQ5XFR0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pabpn1lQ5XFR0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pabpn1lQ5XFR0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pabpn1lQ5XFR0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pabpn1lQ5XFR0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pabpn1lQ5XFR0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pabpn1lQ5XFR0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pabpn1lQ5XFR0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pabpn1lQ5XFR0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pabpn1lQ5XFR0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Pabpn1lQ5XFR0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pabpn1lQ5XFR0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Pabpn1lQ5XFR0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pabpn1lQ5XFR0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pabpn1lQ5XFR0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pabpn1lQ5XFR0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pabpn1lQ5XFR0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pabpn1lQ5XFR0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pabpn1lQ5XFR0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pabpn1lQ5XFR0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pabpn1lQ5XFR0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pabpn1lQ5XFR0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pabpn1lQ5XFR0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Pabpn1lQ5XFR0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Pabpn1lQ5XFR0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pabpn1lQ5XFR0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pabpn1lQ5XFR0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pabpn1lQ5XFR0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pabpn1lQ5XFR0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pabpn1lQ5XFR0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pabpn1lQ5XFR0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pabpn1lQ5XFR0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pabpn1lQ5XFR0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pabpn1lQ5XFR0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pabpn1lQ5XFR0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pabpn1lQ5XFR0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pabpn1lQ5XFR0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pabpn1lQ5XFR0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pabpn1lQ5XFR0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pabpn1lQ5XFR0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pabpn1lQ5XFR0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pabpn1lQ5XFR0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pabpn1lQ5XFR0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pabpn1lQ5XFR0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pabpn1lQ5XFR0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pabpn1lQ5XFR0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pabpn1lQ5XFR0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pabpn1lQ5XFR0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Pabpn1lQ5XFR0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pabpn1lQ5XFR0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pabpn1lQ5XFR0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pabpn1lQ5XFR0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pabpn1lQ5XFR0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pabpn1lQ5XFR0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pabpn1lQ5XFR0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pabpn1lQ5XFR0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pabpn1lQ5XFR0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pabpn1lQ5XFR0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pabpn1lQ5XFR0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Pabpn1lQ5XFR0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pabpn1lQ5XFR0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pabpn1lQ5XFR0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pabpn1lQ5XFR0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pabpn1lQ5XFR0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pabpn1lQ5XFR0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pabpn1lQ5XFR0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pabpn1lQ5XFR0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pabpn1lQ5XFR0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pabpn1lQ5XFR0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pabpn1lQ5XFR0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pabpn1lQ5XFR0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pabpn1lQ5XFR0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pabpn1lQ5XFR0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pabpn1lQ5XFR0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms