Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Fam71bQ5STT6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fam71bQ5STT6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fam71bQ5STT6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fam71bQ5STT6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fam71bQ5STT6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fam71bQ5STT6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fam71bQ5STT6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fam71bQ5STT6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fam71bQ5STT6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fam71bQ5STT6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fam71bQ5STT6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fam71bQ5STT6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fam71bQ5STT6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fam71bQ5STT6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fam71bQ5STT6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fam71bQ5STT6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fam71bQ5STT6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fam71bQ5STT6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam71bQ5STT6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fam71bQ5STT6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fam71bQ5STT6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fam71bQ5STT6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam71bQ5STT6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam71bQ5STT6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam71bQ5STT6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam71bQ5STT6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam71bQ5STT6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fam71bQ5STT6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam71bQ5STT6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam71bQ5STT6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam71bQ5STT6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam71bQ5STT6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam71bQ5STT6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam71bQ5STT6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam71bQ5STT6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam71bQ5STT6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Fam71bQ5STT6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam71bQ5STT6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam71bQ5STT6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam71bQ5STT6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam71bQ5STT6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam71bQ5STT6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam71bQ5STT6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam71bQ5STT6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam71bQ5STT6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam71bQ5STT6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam71bQ5STT6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam71bQ5STT6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Fam71bQ5STT6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fam71bQ5STT6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam71bQ5STT6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam71bQ5STT6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam71bQ5STT6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam71bQ5STT6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam71bQ5STT6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fam71bQ5STT6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam71bQ5STT6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fam71bQ5STT6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fam71bQ5STT6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Fam71bQ5STT6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fam71bQ5STT6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fam71bQ5STT6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam71bQ5STT6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam71bQ5STT6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam71bQ5STT6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam71bQ5STT6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam71bQ5STT6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam71bQ5STT6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam71bQ5STT6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam71bQ5STT6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam71bQ5STT6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam71bQ5STT6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam71bQ5STT6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam71bQ5STT6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam71bQ5STT6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam71bQ5STT6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam71bQ5STT6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam71bQ5STT6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam71bQ5STT6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam71bQ5STT6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam71bQ5STT6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam71bQ5STT6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam71bQ5STT6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam71bQ5STT6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam71bQ5STT6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam71bQ5STT6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam71bQ5STT6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam71bQ5STT6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam71bQ5STT6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam71bQ5STT6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam71bQ5STT6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam71bQ5STT6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam71bQ5STT6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam71bQ5STT6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam71bQ5STT6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam71bQ5STT6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam71bQ5STT6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam71bQ5STT6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam71bQ5STT6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms