Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sft2d1Q5SSN7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sft2d1Q5SSN7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sft2d1Q5SSN7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sft2d1Q5SSN7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sft2d1Q5SSN7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sft2d1Q5SSN7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sft2d1Q5SSN7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sft2d1Q5SSN7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sft2d1Q5SSN7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sft2d1Q5SSN7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sft2d1Q5SSN7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sft2d1Q5SSN7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sft2d1Q5SSN7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sft2d1Q5SSN7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sft2d1Q5SSN7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sft2d1Q5SSN7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sft2d1Q5SSN7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sft2d1Q5SSN7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sft2d1Q5SSN7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sft2d1Q5SSN7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sft2d1Q5SSN7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sft2d1Q5SSN7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sft2d1Q5SSN7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sft2d1Q5SSN7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sft2d1Q5SSN7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sft2d1Q5SSN7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sft2d1Q5SSN7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sft2d1Q5SSN7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sft2d1Q5SSN7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sft2d1Q5SSN7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sft2d1Q5SSN7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sft2d1Q5SSN7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sft2d1Q5SSN7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sft2d1Q5SSN7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sft2d1Q5SSN7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sft2d1Q5SSN7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sft2d1Q5SSN7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sft2d1Q5SSN7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Sft2d1Q5SSN7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sft2d1Q5SSN7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sft2d1Q5SSN7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sft2d1Q5SSN7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sft2d1Q5SSN7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Sft2d1Q5SSN7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sft2d1Q5SSN7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sft2d1Q5SSN7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sft2d1Q5SSN7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sft2d1Q5SSN7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Sft2d1Q5SSN7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sft2d1Q5SSN7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sft2d1Q5SSN7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sft2d1Q5SSN7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sft2d1Q5SSN7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sft2d1Q5SSN7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sft2d1Q5SSN7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sft2d1Q5SSN7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sft2d1Q5SSN7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sft2d1Q5SSN7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sft2d1Q5SSN7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sft2d1Q5SSN7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sft2d1Q5SSN7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sft2d1Q5SSN7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sft2d1Q5SSN7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sft2d1Q5SSN7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sft2d1Q5SSN7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sft2d1Q5SSN7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sft2d1Q5SSN7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sft2d1Q5SSN7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sft2d1Q5SSN7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sft2d1Q5SSN7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sft2d1Q5SSN7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sft2d1Q5SSN7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sft2d1Q5SSN7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sft2d1Q5SSN7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sft2d1Q5SSN7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sft2d1Q5SSN7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sft2d1Q5SSN7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sft2d1Q5SSN7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sft2d1Q5SSN7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sft2d1Q5SSN7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sft2d1Q5SSN7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sft2d1Q5SSN7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sft2d1Q5SSN7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sft2d1Q5SSN7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Sft2d1Q5SSN7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sft2d1Q5SSN7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sft2d1Q5SSN7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sft2d1Q5SSN7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sft2d1Q5SSN7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sft2d1Q5SSN7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sft2d1Q5SSN7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sft2d1Q5SSN7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sft2d1Q5SSN7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sft2d1Q5SSN7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sft2d1Q5SSN7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sft2d1Q5SSN7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 405 ms