Protein–RNA interactions for Protein: Q5PRE5

Proser1, Proline and serine-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Proser1Q5PRE5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Proser1Q5PRE5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Proser1Q5PRE5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Proser1Q5PRE5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Proser1Q5PRE5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Proser1Q5PRE5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Proser1Q5PRE5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Proser1Q5PRE5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Proser1Q5PRE5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Proser1Q5PRE5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Proser1Q5PRE5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Proser1Q5PRE5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Proser1Q5PRE5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Proser1Q5PRE5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Proser1Q5PRE5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Proser1Q5PRE5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Proser1Q5PRE5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Proser1Q5PRE5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Proser1Q5PRE5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Proser1Q5PRE5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Proser1Q5PRE5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Proser1Q5PRE5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Proser1Q5PRE5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Proser1Q5PRE5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Proser1Q5PRE5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Proser1Q5PRE5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Proser1Q5PRE5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Proser1Q5PRE5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Proser1Q5PRE5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Proser1Q5PRE5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Proser1Q5PRE5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Proser1Q5PRE5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Proser1Q5PRE5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Proser1Q5PRE5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Proser1Q5PRE5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Proser1Q5PRE5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Proser1Q5PRE5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Proser1Q5PRE5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Proser1Q5PRE5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Proser1Q5PRE5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Proser1Q5PRE5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Proser1Q5PRE5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Proser1Q5PRE5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Proser1Q5PRE5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Proser1Q5PRE5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Proser1Q5PRE5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Proser1Q5PRE5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Proser1Q5PRE5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Proser1Q5PRE5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Proser1Q5PRE5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Proser1Q5PRE5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Proser1Q5PRE5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Proser1Q5PRE5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Proser1Q5PRE5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Proser1Q5PRE5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Proser1Q5PRE5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Proser1Q5PRE5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Proser1Q5PRE5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Proser1Q5PRE5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Proser1Q5PRE5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Proser1Q5PRE5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Proser1Q5PRE5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Proser1Q5PRE5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Proser1Q5PRE5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Proser1Q5PRE5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Proser1Q5PRE5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Proser1Q5PRE5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Proser1Q5PRE5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Proser1Q5PRE5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Proser1Q5PRE5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Proser1Q5PRE5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Proser1Q5PRE5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Proser1Q5PRE5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Proser1Q5PRE5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Proser1Q5PRE5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Proser1Q5PRE5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Proser1Q5PRE5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Proser1Q5PRE5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Proser1Q5PRE5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Proser1Q5PRE5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Proser1Q5PRE5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Proser1Q5PRE5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Proser1Q5PRE5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Proser1Q5PRE5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Proser1Q5PRE5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Proser1Q5PRE5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Proser1Q5PRE5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Proser1Q5PRE5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Proser1Q5PRE5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Proser1Q5PRE5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Proser1Q5PRE5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Proser1Q5PRE5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Proser1Q5PRE5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Proser1Q5PRE5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Proser1Q5PRE5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Proser1Q5PRE5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Proser1Q5PRE5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Proser1Q5PRE5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Proser1Q5PRE5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Proser1Q5PRE5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms