Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND29

Rilp, Rab-interacting lysosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RilpQ5ND29 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RilpQ5ND29 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RilpQ5ND29 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RilpQ5ND29 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RilpQ5ND29 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RilpQ5ND29 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RilpQ5ND29 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RilpQ5ND29 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RilpQ5ND29 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RilpQ5ND29 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RilpQ5ND29 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RilpQ5ND29 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RilpQ5ND29 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RilpQ5ND29 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RilpQ5ND29 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RilpQ5ND29 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RilpQ5ND29 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RilpQ5ND29 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RilpQ5ND29 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RilpQ5ND29 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RilpQ5ND29 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RilpQ5ND29 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RilpQ5ND29 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RilpQ5ND29 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RilpQ5ND29 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RilpQ5ND29 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RilpQ5ND29 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RilpQ5ND29 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RilpQ5ND29 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RilpQ5ND29 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RilpQ5ND29 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RilpQ5ND29 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RilpQ5ND29 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RilpQ5ND29 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RilpQ5ND29 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RilpQ5ND29 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RilpQ5ND29 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RilpQ5ND29 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RilpQ5ND29 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RilpQ5ND29 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RilpQ5ND29 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RilpQ5ND29 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RilpQ5ND29 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RilpQ5ND29 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RilpQ5ND29 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RilpQ5ND29 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RilpQ5ND29 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RilpQ5ND29 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RilpQ5ND29 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RilpQ5ND29 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RilpQ5ND29 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RilpQ5ND29 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RilpQ5ND29 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RilpQ5ND29 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RilpQ5ND29 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RilpQ5ND29 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RilpQ5ND29 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RilpQ5ND29 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RilpQ5ND29 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RilpQ5ND29 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RilpQ5ND29 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RilpQ5ND29 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RilpQ5ND29 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RilpQ5ND29 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RilpQ5ND29 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RilpQ5ND29 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RilpQ5ND29 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RilpQ5ND29 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RilpQ5ND29 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RilpQ5ND29 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RilpQ5ND29 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RilpQ5ND29 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RilpQ5ND29 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RilpQ5ND29 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RilpQ5ND29 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RilpQ5ND29 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RilpQ5ND29 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RilpQ5ND29 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RilpQ5ND29 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RilpQ5ND29 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RilpQ5ND29 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RilpQ5ND29 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RilpQ5ND29 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RilpQ5ND29 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RilpQ5ND29 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RilpQ5ND29 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RilpQ5ND29 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RilpQ5ND29 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RilpQ5ND29 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RilpQ5ND29 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RilpQ5ND29 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RilpQ5ND29 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RilpQ5ND29 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RilpQ5ND29 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RilpQ5ND29 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RilpQ5ND29 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RilpQ5ND29 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RilpQ5ND29 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RilpQ5ND29 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RilpQ5ND29 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms