Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCR9

Nsrp1, Nuclear speckle splicing regulatory protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsrp1Q5NCR9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Nsrp1Q5NCR9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Nsrp1Q5NCR9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Nsrp1Q5NCR9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Nsrp1Q5NCR9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Nsrp1Q5NCR9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Nsrp1Q5NCR9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Nsrp1Q5NCR9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Nsrp1Q5NCR9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Nsrp1Q5NCR9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Nsrp1Q5NCR9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Nsrp1Q5NCR9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Nsrp1Q5NCR9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Nsrp1Q5NCR9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Nsrp1Q5NCR9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Nsrp1Q5NCR9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Nsrp1Q5NCR9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Nsrp1Q5NCR9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Nsrp1Q5NCR9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Nsrp1Q5NCR9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Nsrp1Q5NCR9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Nsrp1Q5NCR9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Nsrp1Q5NCR9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Nsrp1Q5NCR9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Nsrp1Q5NCR9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Nsrp1Q5NCR9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Nsrp1Q5NCR9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Nsrp1Q5NCR9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Nsrp1Q5NCR9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Nsrp1Q5NCR9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Nsrp1Q5NCR9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Nsrp1Q5NCR9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Nsrp1Q5NCR9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Nsrp1Q5NCR9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nsrp1Q5NCR9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Nsrp1Q5NCR9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Nsrp1Q5NCR9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Nsrp1Q5NCR9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Nsrp1Q5NCR9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Nsrp1Q5NCR9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Nsrp1Q5NCR9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Nsrp1Q5NCR9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Nsrp1Q5NCR9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Nsrp1Q5NCR9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Nsrp1Q5NCR9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Nsrp1Q5NCR9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Nsrp1Q5NCR9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Nsrp1Q5NCR9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Nsrp1Q5NCR9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Nsrp1Q5NCR9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Nsrp1Q5NCR9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Nsrp1Q5NCR9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Nsrp1Q5NCR9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Nsrp1Q5NCR9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Nsrp1Q5NCR9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Nsrp1Q5NCR9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Nsrp1Q5NCR9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Nsrp1Q5NCR9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Nsrp1Q5NCR9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Nsrp1Q5NCR9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Nsrp1Q5NCR9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Nsrp1Q5NCR9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Nsrp1Q5NCR9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Nsrp1Q5NCR9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Nsrp1Q5NCR9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Nsrp1Q5NCR9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Nsrp1Q5NCR9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Nsrp1Q5NCR9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Nsrp1Q5NCR9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nsrp1Q5NCR9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Nsrp1Q5NCR9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nsrp1Q5NCR9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nsrp1Q5NCR9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nsrp1Q5NCR9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nsrp1Q5NCR9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nsrp1Q5NCR9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Nsrp1Q5NCR9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Nsrp1Q5NCR9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Nsrp1Q5NCR9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Nsrp1Q5NCR9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Nsrp1Q5NCR9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nsrp1Q5NCR9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Nsrp1Q5NCR9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Nsrp1Q5NCR9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Nsrp1Q5NCR9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Nsrp1Q5NCR9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Nsrp1Q5NCR9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nsrp1Q5NCR9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nsrp1Q5NCR9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nsrp1Q5NCR9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nsrp1Q5NCR9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Nsrp1Q5NCR9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nsrp1Q5NCR9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nsrp1Q5NCR9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nsrp1Q5NCR9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nsrp1Q5NCR9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nsrp1Q5NCR9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nsrp1Q5NCR9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nsrp1Q5NCR9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Nsrp1Q5NCR9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms