Protein–RNA interactions for Protein: Q5BN45

UPF0691 protein C9orf116 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5BN45 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q5BN45 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q5BN45 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q5BN45 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q5BN45 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q5BN45 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q5BN45 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q5BN45 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q5BN45 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q5BN45 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q5BN45 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q5BN45 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q5BN45 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q5BN45 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q5BN45 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q5BN45 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q5BN45 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q5BN45 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q5BN45 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q5BN45 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q5BN45 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q5BN45 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q5BN45 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q5BN45 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q5BN45 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q5BN45 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q5BN45 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q5BN45 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q5BN45 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q5BN45 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q5BN45 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q5BN45 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q5BN45 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q5BN45 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q5BN45 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q5BN45 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Q5BN45 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q5BN45 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q5BN45 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q5BN45 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q5BN45 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q5BN45 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q5BN45 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q5BN45 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q5BN45 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q5BN45 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q5BN45 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Q5BN45 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q5BN45 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q5BN45 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q5BN45 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q5BN45 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q5BN45 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q5BN45 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q5BN45 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q5BN45 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q5BN45 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q5BN45 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q5BN45 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q5BN45 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q5BN45 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q5BN45 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q5BN45 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q5BN45 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q5BN45 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q5BN45 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q5BN45 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q5BN45 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q5BN45 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q5BN45 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Q5BN45 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q5BN45 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q5BN45 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q5BN45 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q5BN45 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q5BN45 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q5BN45 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q5BN45 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q5BN45 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q5BN45 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q5BN45 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q5BN45 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q5BN45 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q5BN45 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q5BN45 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Q5BN45 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q5BN45 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q5BN45 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q5BN45 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Q5BN45 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q5BN45 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q5BN45 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q5BN45 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q5BN45 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q5BN45 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q5BN45 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q5BN45 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q5BN45 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q5BN45 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q5BN45 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms