Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Syne3Q4FZC9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Syne3Q4FZC9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Syne3Q4FZC9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Syne3Q4FZC9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Syne3Q4FZC9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Syne3Q4FZC9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Syne3Q4FZC9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Syne3Q4FZC9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Syne3Q4FZC9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Syne3Q4FZC9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Syne3Q4FZC9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Syne3Q4FZC9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Syne3Q4FZC9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Syne3Q4FZC9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Syne3Q4FZC9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Syne3Q4FZC9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Syne3Q4FZC9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Syne3Q4FZC9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Syne3Q4FZC9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Syne3Q4FZC9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Syne3Q4FZC9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Syne3Q4FZC9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Syne3Q4FZC9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Syne3Q4FZC9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Syne3Q4FZC9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Syne3Q4FZC9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Syne3Q4FZC9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Syne3Q4FZC9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Syne3Q4FZC9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Syne3Q4FZC9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Syne3Q4FZC9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Syne3Q4FZC9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Syne3Q4FZC9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Syne3Q4FZC9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Syne3Q4FZC9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Syne3Q4FZC9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Syne3Q4FZC9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Syne3Q4FZC9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Syne3Q4FZC9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Syne3Q4FZC9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Syne3Q4FZC9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Syne3Q4FZC9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Syne3Q4FZC9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Syne3Q4FZC9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Syne3Q4FZC9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Syne3Q4FZC9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Syne3Q4FZC9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Syne3Q4FZC9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Syne3Q4FZC9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Syne3Q4FZC9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Syne3Q4FZC9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Syne3Q4FZC9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Syne3Q4FZC9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Syne3Q4FZC9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Syne3Q4FZC9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Syne3Q4FZC9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Syne3Q4FZC9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Syne3Q4FZC9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Syne3Q4FZC9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Syne3Q4FZC9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Syne3Q4FZC9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Syne3Q4FZC9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Syne3Q4FZC9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Syne3Q4FZC9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Syne3Q4FZC9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Syne3Q4FZC9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Syne3Q4FZC9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Syne3Q4FZC9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Syne3Q4FZC9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Syne3Q4FZC9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Syne3Q4FZC9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Syne3Q4FZC9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Syne3Q4FZC9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Syne3Q4FZC9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Syne3Q4FZC9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Syne3Q4FZC9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Syne3Q4FZC9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Syne3Q4FZC9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Syne3Q4FZC9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Syne3Q4FZC9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Syne3Q4FZC9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Syne3Q4FZC9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Syne3Q4FZC9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Syne3Q4FZC9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Syne3Q4FZC9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Syne3Q4FZC9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Syne3Q4FZC9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Syne3Q4FZC9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Syne3Q4FZC9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Syne3Q4FZC9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Syne3Q4FZC9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Syne3Q4FZC9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Syne3Q4FZC9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Syne3Q4FZC9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Syne3Q4FZC9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Syne3Q4FZC9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Syne3Q4FZC9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Syne3Q4FZC9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Syne3Q4FZC9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms