Protein–RNA interactions for Protein: Q3V460

Smim26, Gene model 561, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim26Q3V460 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim26Q3V460 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim26Q3V460 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim26Q3V460 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim26Q3V460 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim26Q3V460 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim26Q3V460 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim26Q3V460 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim26Q3V460 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim26Q3V460 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim26Q3V460 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim26Q3V460 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim26Q3V460 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim26Q3V460 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim26Q3V460 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smim26Q3V460 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim26Q3V460 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim26Q3V460 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim26Q3V460 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim26Q3V460 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim26Q3V460 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim26Q3V460 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim26Q3V460 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim26Q3V460 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim26Q3V460 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim26Q3V460 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim26Q3V460 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim26Q3V460 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim26Q3V460 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim26Q3V460 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim26Q3V460 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim26Q3V460 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim26Q3V460 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smim26Q3V460 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smim26Q3V460 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smim26Q3V460 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smim26Q3V460 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smim26Q3V460 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smim26Q3V460 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smim26Q3V460 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smim26Q3V460 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smim26Q3V460 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smim26Q3V460 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smim26Q3V460 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smim26Q3V460 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smim26Q3V460 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smim26Q3V460 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim26Q3V460 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smim26Q3V460 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smim26Q3V460 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim26Q3V460 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim26Q3V460 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim26Q3V460 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim26Q3V460 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim26Q3V460 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim26Q3V460 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim26Q3V460 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim26Q3V460 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim26Q3V460 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim26Q3V460 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim26Q3V460 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim26Q3V460 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smim26Q3V460 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smim26Q3V460 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smim26Q3V460 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim26Q3V460 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim26Q3V460 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim26Q3V460 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim26Q3V460 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim26Q3V460 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim26Q3V460 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim26Q3V460 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim26Q3V460 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim26Q3V460 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim26Q3V460 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim26Q3V460 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim26Q3V460 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim26Q3V460 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim26Q3V460 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim26Q3V460 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim26Q3V460 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim26Q3V460 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim26Q3V460 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim26Q3V460 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim26Q3V460 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim26Q3V460 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim26Q3V460 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim26Q3V460 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim26Q3V460 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim26Q3V460 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim26Q3V460 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim26Q3V460 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim26Q3V460 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim26Q3V460 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim26Q3V460 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim26Q3V460 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim26Q3V460 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim26Q3V460 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim26Q3V460 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim26Q3V460 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms