Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1D3

Ampd1, AMP deaminase 1, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ampd1Q3V1D3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ampd1Q3V1D3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ampd1Q3V1D3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ampd1Q3V1D3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ampd1Q3V1D3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ampd1Q3V1D3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ampd1Q3V1D3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ampd1Q3V1D3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Ampd1Q3V1D3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ampd1Q3V1D3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ampd1Q3V1D3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ampd1Q3V1D3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ampd1Q3V1D3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ampd1Q3V1D3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ampd1Q3V1D3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ampd1Q3V1D3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ampd1Q3V1D3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ampd1Q3V1D3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ampd1Q3V1D3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ampd1Q3V1D3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ampd1Q3V1D3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ampd1Q3V1D3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ampd1Q3V1D3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ampd1Q3V1D3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Ampd1Q3V1D3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ampd1Q3V1D3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Ampd1Q3V1D3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ampd1Q3V1D3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ampd1Q3V1D3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ampd1Q3V1D3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ampd1Q3V1D3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ampd1Q3V1D3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Ampd1Q3V1D3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ampd1Q3V1D3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ampd1Q3V1D3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ampd1Q3V1D3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ampd1Q3V1D3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ampd1Q3V1D3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ampd1Q3V1D3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ampd1Q3V1D3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ampd1Q3V1D3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ampd1Q3V1D3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ampd1Q3V1D3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ampd1Q3V1D3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ampd1Q3V1D3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ampd1Q3V1D3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ampd1Q3V1D3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ampd1Q3V1D3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ampd1Q3V1D3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ampd1Q3V1D3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ampd1Q3V1D3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ampd1Q3V1D3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ampd1Q3V1D3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ampd1Q3V1D3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ampd1Q3V1D3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ampd1Q3V1D3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ampd1Q3V1D3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ampd1Q3V1D3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ampd1Q3V1D3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ampd1Q3V1D3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ampd1Q3V1D3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ampd1Q3V1D3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Ampd1Q3V1D3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ampd1Q3V1D3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ampd1Q3V1D3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ampd1Q3V1D3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ampd1Q3V1D3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ampd1Q3V1D3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ampd1Q3V1D3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ampd1Q3V1D3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ampd1Q3V1D3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ampd1Q3V1D3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ampd1Q3V1D3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ampd1Q3V1D3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ampd1Q3V1D3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ampd1Q3V1D3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ampd1Q3V1D3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ampd1Q3V1D3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ampd1Q3V1D3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ampd1Q3V1D3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ampd1Q3V1D3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ampd1Q3V1D3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Ampd1Q3V1D3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ampd1Q3V1D3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ampd1Q3V1D3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ampd1Q3V1D3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ampd1Q3V1D3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ampd1Q3V1D3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ampd1Q3V1D3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ampd1Q3V1D3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ampd1Q3V1D3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ampd1Q3V1D3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ampd1Q3V1D3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ampd1Q3V1D3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ampd1Q3V1D3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ampd1Q3V1D3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ampd1Q3V1D3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ampd1Q3V1D3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ampd1Q3V1D3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ampd1Q3V1D3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms