Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0T4

Itgad, Integrin alpha-D, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgadQ3V0T4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ItgadQ3V0T4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ItgadQ3V0T4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ItgadQ3V0T4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
ItgadQ3V0T4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ItgadQ3V0T4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ItgadQ3V0T4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ItgadQ3V0T4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ItgadQ3V0T4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ItgadQ3V0T4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ItgadQ3V0T4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ItgadQ3V0T4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ItgadQ3V0T4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ItgadQ3V0T4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ItgadQ3V0T4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ItgadQ3V0T4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ItgadQ3V0T4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ItgadQ3V0T4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ItgadQ3V0T4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ItgadQ3V0T4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ItgadQ3V0T4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ItgadQ3V0T4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ItgadQ3V0T4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ItgadQ3V0T4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ItgadQ3V0T4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
ItgadQ3V0T4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ItgadQ3V0T4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ItgadQ3V0T4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ItgadQ3V0T4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ItgadQ3V0T4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ItgadQ3V0T4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ItgadQ3V0T4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ItgadQ3V0T4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ItgadQ3V0T4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ItgadQ3V0T4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ItgadQ3V0T4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ItgadQ3V0T4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ItgadQ3V0T4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ItgadQ3V0T4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ItgadQ3V0T4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
ItgadQ3V0T4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ItgadQ3V0T4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ItgadQ3V0T4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
ItgadQ3V0T4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ItgadQ3V0T4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ItgadQ3V0T4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ItgadQ3V0T4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ItgadQ3V0T4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ItgadQ3V0T4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ItgadQ3V0T4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ItgadQ3V0T4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ItgadQ3V0T4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ItgadQ3V0T4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ItgadQ3V0T4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ItgadQ3V0T4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ItgadQ3V0T4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ItgadQ3V0T4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ItgadQ3V0T4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ItgadQ3V0T4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ItgadQ3V0T4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ItgadQ3V0T4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ItgadQ3V0T4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ItgadQ3V0T4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ItgadQ3V0T4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ItgadQ3V0T4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ItgadQ3V0T4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ItgadQ3V0T4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ItgadQ3V0T4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ItgadQ3V0T4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ItgadQ3V0T4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ItgadQ3V0T4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ItgadQ3V0T4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ItgadQ3V0T4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ItgadQ3V0T4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ItgadQ3V0T4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ItgadQ3V0T4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ItgadQ3V0T4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ItgadQ3V0T4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ItgadQ3V0T4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ItgadQ3V0T4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ItgadQ3V0T4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ItgadQ3V0T4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ItgadQ3V0T4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ItgadQ3V0T4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ItgadQ3V0T4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ItgadQ3V0T4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ItgadQ3V0T4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ItgadQ3V0T4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ItgadQ3V0T4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ItgadQ3V0T4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ItgadQ3V0T4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ItgadQ3V0T4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ItgadQ3V0T4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ItgadQ3V0T4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ItgadQ3V0T4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ItgadQ3V0T4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ItgadQ3V0T4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ItgadQ3V0T4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ItgadQ3V0T4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ItgadQ3V0T4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.9 ms