Protein–RNA interactions for Protein: Q3V079

Bbof1, Basal body-orientation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbof1Q3V079 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Bbof1Q3V079 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Bbof1Q3V079 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Bbof1Q3V079 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Bbof1Q3V079 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Bbof1Q3V079 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Bbof1Q3V079 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Bbof1Q3V079 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Bbof1Q3V079 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Bbof1Q3V079 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Bbof1Q3V079 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Bbof1Q3V079 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Bbof1Q3V079 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Bbof1Q3V079 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Bbof1Q3V079 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Bbof1Q3V079 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Bbof1Q3V079 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Bbof1Q3V079 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Bbof1Q3V079 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Bbof1Q3V079 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Bbof1Q3V079 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Bbof1Q3V079 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Bbof1Q3V079 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Bbof1Q3V079 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Bbof1Q3V079 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Bbof1Q3V079 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Bbof1Q3V079 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Bbof1Q3V079 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Bbof1Q3V079 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Bbof1Q3V079 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Bbof1Q3V079 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Bbof1Q3V079 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Bbof1Q3V079 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Bbof1Q3V079 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Bbof1Q3V079 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Bbof1Q3V079 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Bbof1Q3V079 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Bbof1Q3V079 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Bbof1Q3V079 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Bbof1Q3V079 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Bbof1Q3V079 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Bbof1Q3V079 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Bbof1Q3V079 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Bbof1Q3V079 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Bbof1Q3V079 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Bbof1Q3V079 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Bbof1Q3V079 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Bbof1Q3V079 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Bbof1Q3V079 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Bbof1Q3V079 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Bbof1Q3V079 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Bbof1Q3V079 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Bbof1Q3V079 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Bbof1Q3V079 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Bbof1Q3V079 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Bbof1Q3V079 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Bbof1Q3V079 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Bbof1Q3V079 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Bbof1Q3V079 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Bbof1Q3V079 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Bbof1Q3V079 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Bbof1Q3V079 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Bbof1Q3V079 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Bbof1Q3V079 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Bbof1Q3V079 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Bbof1Q3V079 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Bbof1Q3V079 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Bbof1Q3V079 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Bbof1Q3V079 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Bbof1Q3V079 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Bbof1Q3V079 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Bbof1Q3V079 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Bbof1Q3V079 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Bbof1Q3V079 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Bbof1Q3V079 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Bbof1Q3V079 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Bbof1Q3V079 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Bbof1Q3V079 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Bbof1Q3V079 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Bbof1Q3V079 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Bbof1Q3V079 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Bbof1Q3V079 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Bbof1Q3V079 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Bbof1Q3V079 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Bbof1Q3V079 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Bbof1Q3V079 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Bbof1Q3V079 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Bbof1Q3V079 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Bbof1Q3V079 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Bbof1Q3V079 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Bbof1Q3V079 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Bbof1Q3V079 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Bbof1Q3V079 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Bbof1Q3V079 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Bbof1Q3V079 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Bbof1Q3V079 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Bbof1Q3V079 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Bbof1Q3V079 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Bbof1Q3V079 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Bbof1Q3V079 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms