Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD7

Fam71f1, Protein FAM71F1, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71f1Q3UZD7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fam71f1Q3UZD7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fam71f1Q3UZD7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fam71f1Q3UZD7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fam71f1Q3UZD7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fam71f1Q3UZD7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fam71f1Q3UZD7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fam71f1Q3UZD7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fam71f1Q3UZD7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fam71f1Q3UZD7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fam71f1Q3UZD7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fam71f1Q3UZD7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fam71f1Q3UZD7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fam71f1Q3UZD7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fam71f1Q3UZD7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fam71f1Q3UZD7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fam71f1Q3UZD7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fam71f1Q3UZD7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fam71f1Q3UZD7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fam71f1Q3UZD7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fam71f1Q3UZD7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fam71f1Q3UZD7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fam71f1Q3UZD7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fam71f1Q3UZD7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fam71f1Q3UZD7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fam71f1Q3UZD7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam71f1Q3UZD7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam71f1Q3UZD7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam71f1Q3UZD7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam71f1Q3UZD7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam71f1Q3UZD7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fam71f1Q3UZD7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fam71f1Q3UZD7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam71f1Q3UZD7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam71f1Q3UZD7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam71f1Q3UZD7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam71f1Q3UZD7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam71f1Q3UZD7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam71f1Q3UZD7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam71f1Q3UZD7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam71f1Q3UZD7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam71f1Q3UZD7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam71f1Q3UZD7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam71f1Q3UZD7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam71f1Q3UZD7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam71f1Q3UZD7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam71f1Q3UZD7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam71f1Q3UZD7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam71f1Q3UZD7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam71f1Q3UZD7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam71f1Q3UZD7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam71f1Q3UZD7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam71f1Q3UZD7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam71f1Q3UZD7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam71f1Q3UZD7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam71f1Q3UZD7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam71f1Q3UZD7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam71f1Q3UZD7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam71f1Q3UZD7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam71f1Q3UZD7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam71f1Q3UZD7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam71f1Q3UZD7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam71f1Q3UZD7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam71f1Q3UZD7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam71f1Q3UZD7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam71f1Q3UZD7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam71f1Q3UZD7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam71f1Q3UZD7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam71f1Q3UZD7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam71f1Q3UZD7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam71f1Q3UZD7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam71f1Q3UZD7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam71f1Q3UZD7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam71f1Q3UZD7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam71f1Q3UZD7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam71f1Q3UZD7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam71f1Q3UZD7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam71f1Q3UZD7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam71f1Q3UZD7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam71f1Q3UZD7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam71f1Q3UZD7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam71f1Q3UZD7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam71f1Q3UZD7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam71f1Q3UZD7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam71f1Q3UZD7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam71f1Q3UZD7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam71f1Q3UZD7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam71f1Q3UZD7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam71f1Q3UZD7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam71f1Q3UZD7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam71f1Q3UZD7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam71f1Q3UZD7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam71f1Q3UZD7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam71f1Q3UZD7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam71f1Q3UZD7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam71f1Q3UZD7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam71f1Q3UZD7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam71f1Q3UZD7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Fam71f1Q3UZD7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam71f1Q3UZD7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms