Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rnpc3Q3UZ01 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rnpc3Q3UZ01 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rnpc3Q3UZ01 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rnpc3Q3UZ01 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rnpc3Q3UZ01 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rnpc3Q3UZ01 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rnpc3Q3UZ01 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rnpc3Q3UZ01 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rnpc3Q3UZ01 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Rnpc3Q3UZ01 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rnpc3Q3UZ01 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rnpc3Q3UZ01 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rnpc3Q3UZ01 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rnpc3Q3UZ01 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rnpc3Q3UZ01 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rnpc3Q3UZ01 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rnpc3Q3UZ01 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rnpc3Q3UZ01 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Rnpc3Q3UZ01 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rnpc3Q3UZ01 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rnpc3Q3UZ01 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rnpc3Q3UZ01 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rnpc3Q3UZ01 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rnpc3Q3UZ01 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Rnpc3Q3UZ01 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rnpc3Q3UZ01 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rnpc3Q3UZ01 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rnpc3Q3UZ01 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rnpc3Q3UZ01 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rnpc3Q3UZ01 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Rnpc3Q3UZ01 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rnpc3Q3UZ01 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rnpc3Q3UZ01 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Rnpc3Q3UZ01 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rnpc3Q3UZ01 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Rnpc3Q3UZ01 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rnpc3Q3UZ01 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
Rnpc3Q3UZ01 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rnpc3Q3UZ01 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rnpc3Q3UZ01 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rnpc3Q3UZ01 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rnpc3Q3UZ01 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Rnpc3Q3UZ01 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rnpc3Q3UZ01 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Rnpc3Q3UZ01 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Rnpc3Q3UZ01 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rnpc3Q3UZ01 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rnpc3Q3UZ01 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rnpc3Q3UZ01 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rnpc3Q3UZ01 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rnpc3Q3UZ01 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rnpc3Q3UZ01 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rnpc3Q3UZ01 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rnpc3Q3UZ01 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Rnpc3Q3UZ01 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rnpc3Q3UZ01 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rnpc3Q3UZ01 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rnpc3Q3UZ01 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rnpc3Q3UZ01 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rnpc3Q3UZ01 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rnpc3Q3UZ01 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Rnpc3Q3UZ01 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rnpc3Q3UZ01 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rnpc3Q3UZ01 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rnpc3Q3UZ01 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rnpc3Q3UZ01 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rnpc3Q3UZ01 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rnpc3Q3UZ01 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rnpc3Q3UZ01 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rnpc3Q3UZ01 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rnpc3Q3UZ01 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rnpc3Q3UZ01 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rnpc3Q3UZ01 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rnpc3Q3UZ01 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rnpc3Q3UZ01 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rnpc3Q3UZ01 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rnpc3Q3UZ01 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rnpc3Q3UZ01 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rnpc3Q3UZ01 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rnpc3Q3UZ01 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rnpc3Q3UZ01 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rnpc3Q3UZ01 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rnpc3Q3UZ01 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rnpc3Q3UZ01 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rnpc3Q3UZ01 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rnpc3Q3UZ01 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Rnpc3Q3UZ01 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rnpc3Q3UZ01 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rnpc3Q3UZ01 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Rnpc3Q3UZ01 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rnpc3Q3UZ01 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rnpc3Q3UZ01 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rnpc3Q3UZ01 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Rnpc3Q3UZ01 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Rnpc3Q3UZ01 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rnpc3Q3UZ01 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rnpc3Q3UZ01 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rnpc3Q3UZ01 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rnpc3Q3UZ01 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms