Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS0

Gm6899, Predicted gene 6899, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6899Q3USS0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm6899Q3USS0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm6899Q3USS0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm6899Q3USS0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm6899Q3USS0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm6899Q3USS0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm6899Q3USS0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm6899Q3USS0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm6899Q3USS0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm6899Q3USS0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm6899Q3USS0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm6899Q3USS0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm6899Q3USS0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm6899Q3USS0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm6899Q3USS0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm6899Q3USS0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm6899Q3USS0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm6899Q3USS0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm6899Q3USS0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm6899Q3USS0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm6899Q3USS0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm6899Q3USS0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm6899Q3USS0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm6899Q3USS0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm6899Q3USS0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm6899Q3USS0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm6899Q3USS0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm6899Q3USS0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm6899Q3USS0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm6899Q3USS0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm6899Q3USS0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gm6899Q3USS0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm6899Q3USS0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm6899Q3USS0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm6899Q3USS0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm6899Q3USS0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm6899Q3USS0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm6899Q3USS0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm6899Q3USS0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm6899Q3USS0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm6899Q3USS0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm6899Q3USS0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm6899Q3USS0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm6899Q3USS0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm6899Q3USS0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm6899Q3USS0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm6899Q3USS0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm6899Q3USS0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm6899Q3USS0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm6899Q3USS0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm6899Q3USS0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm6899Q3USS0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm6899Q3USS0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm6899Q3USS0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm6899Q3USS0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm6899Q3USS0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm6899Q3USS0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm6899Q3USS0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm6899Q3USS0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm6899Q3USS0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm6899Q3USS0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm6899Q3USS0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm6899Q3USS0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm6899Q3USS0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm6899Q3USS0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm6899Q3USS0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm6899Q3USS0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm6899Q3USS0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm6899Q3USS0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm6899Q3USS0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm6899Q3USS0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm6899Q3USS0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm6899Q3USS0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm6899Q3USS0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm6899Q3USS0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm6899Q3USS0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm6899Q3USS0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm6899Q3USS0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm6899Q3USS0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm6899Q3USS0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm6899Q3USS0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm6899Q3USS0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm6899Q3USS0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm6899Q3USS0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm6899Q3USS0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm6899Q3USS0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm6899Q3USS0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm6899Q3USS0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm6899Q3USS0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm6899Q3USS0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm6899Q3USS0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm6899Q3USS0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm6899Q3USS0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm6899Q3USS0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm6899Q3USS0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm6899Q3USS0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm6899Q3USS0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm6899Q3USS0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm6899Q3USS0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm6899Q3USS0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms