Protein–RNA interactions for Protein: Q3URY4

Gm10549, Predicted gene 10549 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10549Q3URY4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm10549Q3URY4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm10549Q3URY4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm10549Q3URY4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm10549Q3URY4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm10549Q3URY4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm10549Q3URY4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm10549Q3URY4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm10549Q3URY4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm10549Q3URY4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm10549Q3URY4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm10549Q3URY4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm10549Q3URY4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm10549Q3URY4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm10549Q3URY4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm10549Q3URY4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm10549Q3URY4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm10549Q3URY4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm10549Q3URY4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm10549Q3URY4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm10549Q3URY4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm10549Q3URY4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm10549Q3URY4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm10549Q3URY4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm10549Q3URY4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm10549Q3URY4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm10549Q3URY4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm10549Q3URY4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm10549Q3URY4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm10549Q3URY4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm10549Q3URY4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm10549Q3URY4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm10549Q3URY4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm10549Q3URY4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm10549Q3URY4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm10549Q3URY4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm10549Q3URY4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm10549Q3URY4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm10549Q3URY4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm10549Q3URY4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm10549Q3URY4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm10549Q3URY4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm10549Q3URY4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm10549Q3URY4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm10549Q3URY4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm10549Q3URY4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm10549Q3URY4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm10549Q3URY4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm10549Q3URY4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm10549Q3URY4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm10549Q3URY4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm10549Q3URY4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm10549Q3URY4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm10549Q3URY4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm10549Q3URY4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm10549Q3URY4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm10549Q3URY4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm10549Q3URY4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm10549Q3URY4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm10549Q3URY4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm10549Q3URY4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm10549Q3URY4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm10549Q3URY4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm10549Q3URY4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm10549Q3URY4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm10549Q3URY4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm10549Q3URY4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm10549Q3URY4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10549Q3URY4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10549Q3URY4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10549Q3URY4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10549Q3URY4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10549Q3URY4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10549Q3URY4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10549Q3URY4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10549Q3URY4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm10549Q3URY4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm10549Q3URY4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm10549Q3URY4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm10549Q3URY4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm10549Q3URY4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm10549Q3URY4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm10549Q3URY4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm10549Q3URY4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm10549Q3URY4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm10549Q3URY4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm10549Q3URY4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm10549Q3URY4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm10549Q3URY4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm10549Q3URY4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm10549Q3URY4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm10549Q3URY4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm10549Q3URY4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm10549Q3URY4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm10549Q3URY4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm10549Q3URY4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm10549Q3URY4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm10549Q3URY4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm10549Q3URY4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm10549Q3URY4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms