Protein–RNA interactions for Protein: Q3URF8

Kctd21, BTB/POZ domain-containing protein KCTD21, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kctd21Q3URF8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Kctd21Q3URF8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kctd21Q3URF8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kctd21Q3URF8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kctd21Q3URF8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kctd21Q3URF8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kctd21Q3URF8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kctd21Q3URF8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kctd21Q3URF8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kctd21Q3URF8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kctd21Q3URF8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kctd21Q3URF8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Kctd21Q3URF8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kctd21Q3URF8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Kctd21Q3URF8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kctd21Q3URF8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kctd21Q3URF8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kctd21Q3URF8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kctd21Q3URF8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kctd21Q3URF8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kctd21Q3URF8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kctd21Q3URF8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kctd21Q3URF8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kctd21Q3URF8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kctd21Q3URF8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kctd21Q3URF8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kctd21Q3URF8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kctd21Q3URF8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kctd21Q3URF8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kctd21Q3URF8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kctd21Q3URF8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kctd21Q3URF8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kctd21Q3URF8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kctd21Q3URF8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kctd21Q3URF8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kctd21Q3URF8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kctd21Q3URF8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kctd21Q3URF8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kctd21Q3URF8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kctd21Q3URF8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kctd21Q3URF8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kctd21Q3URF8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kctd21Q3URF8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kctd21Q3URF8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kctd21Q3URF8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kctd21Q3URF8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kctd21Q3URF8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kctd21Q3URF8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kctd21Q3URF8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kctd21Q3URF8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Kctd21Q3URF8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kctd21Q3URF8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kctd21Q3URF8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kctd21Q3URF8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kctd21Q3URF8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kctd21Q3URF8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kctd21Q3URF8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kctd21Q3URF8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kctd21Q3URF8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kctd21Q3URF8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kctd21Q3URF8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kctd21Q3URF8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kctd21Q3URF8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kctd21Q3URF8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kctd21Q3URF8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kctd21Q3URF8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Kctd21Q3URF8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kctd21Q3URF8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kctd21Q3URF8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kctd21Q3URF8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kctd21Q3URF8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kctd21Q3URF8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kctd21Q3URF8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kctd21Q3URF8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kctd21Q3URF8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kctd21Q3URF8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kctd21Q3URF8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kctd21Q3URF8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kctd21Q3URF8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kctd21Q3URF8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kctd21Q3URF8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kctd21Q3URF8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kctd21Q3URF8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kctd21Q3URF8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kctd21Q3URF8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kctd21Q3URF8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kctd21Q3URF8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kctd21Q3URF8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kctd21Q3URF8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kctd21Q3URF8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kctd21Q3URF8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kctd21Q3URF8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kctd21Q3URF8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kctd21Q3URF8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kctd21Q3URF8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kctd21Q3URF8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kctd21Q3URF8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kctd21Q3URF8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kctd21Q3URF8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kctd21Q3URF8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms